More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3907 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  87.09 
 
 		 377 aa  657    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  100 
 
 		 734 aa  1491    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  86.49 
 
 		 354 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  61.73 
 
 		 365 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  48.49 
 
 		 359 aa  324  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  49.57 
 
 		 357 aa  314  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  46.72 
 
 		 374 aa  300  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  46.47 
 
 		 361 aa  289  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  43.06 
 
 		 349 aa  259  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  43.3 
 
 		 352 aa  259  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  52.1 
 
 		 348 aa  252  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  39.94 
 
 		 369 aa  240  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  38.68 
 
 		 374 aa  236  9e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  39.07 
 
 		 365 aa  226  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  38.84 
 
 		 371 aa  225  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  36.31 
 
 		 378 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  45.52 
 
 		 326 aa  225  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  37.11 
 
 		 374 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  37.39 
 
 		 382 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  39.59 
 
 		 367 aa  219  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  37.32 
 
 		 380 aa  216  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  38.66 
 
 		 396 aa  216  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.75 
 
 		 366 aa  215  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  37.75 
 
 		 376 aa  214  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.03 
 
 		 387 aa  214  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  45.87 
 
 		 335 aa  214  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  38.19 
 
 		 386 aa  213  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  39.74 
 
 		 481 aa  210  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.56 
 
 		 309 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  47.56 
 
 		 309 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  47.45 
 
 		 326 aa  208  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  37.82 
 
 		 371 aa  205  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.42 
 
 		 381 aa  205  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  36.02 
 
 		 372 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  36.31 
 
 		 369 aa  203  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  37.03 
 
 		 377 aa  202  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  36.31 
 
 		 367 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  35.55 
 
 		 388 aa  201  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  37.11 
 
 		 374 aa  201  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  34.99 
 
 		 410 aa  197  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  47.7 
 
 		 332 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  36.92 
 
 		 376 aa  196  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  35.57 
 
 		 351 aa  196  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.59 
 
 		 396 aa  194  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  47.52 
 
 		 341 aa  194  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  34.99 
 
 		 351 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.06 
 
 		 384 aa  192  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  34.4 
 
 		 351 aa  191  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  33.82 
 
 		 351 aa  190  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  34.11 
 
 		 351 aa  189  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  34.11 
 
 		 352 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  34.69 
 
 		 351 aa  188  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  33.82 
 
 		 351 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  33.82 
 
 		 351 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.17 
 
 		 313 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  44.44 
 
 		 315 aa  181  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  43.1 
 
 		 311 aa  180  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  45.73 
 
 		 326 aa  180  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0407  extracellular solute-binding protein family 3  45.53 
 
 		 315 aa  179  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  41.27 
 
 		 314 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  42.75 
 
 		 310 aa  179  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  40.41 
 
 		 340 aa  178  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  35.33 
 
 		 353 aa  177  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  35.33 
 
 		 353 aa  177  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  38.05 
 
 		 356 aa  177  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  41 
 
 		 309 aa  177  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  44.87 
 
 		 327 aa  177  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1530  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  43.78 
 
 		 311 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  34.11 
 
 		 352 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  42.68 
 
 		 312 aa  174  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  39.17 
 
 		 339 aa  173  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  43.96 
 
 		 311 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  42.34 
 
 		 301 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  39.09 
 
 		 358 aa  171  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  40.17 
 
 		 313 aa  170  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  40.17 
 
 		 313 aa  170  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5873  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 		 310 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0885292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3934  twin-arginine translocation pathway signal  41.18 
 
 		 310 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0254446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4432  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 		 310 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  39.75 
 
 		 313 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0397  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.68 
 
 		 314 aa  168  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  38.56 
 
 		 330 aa  167  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3864  extracellular solute-binding protein  41.74 
 
 		 313 aa  167  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384517  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  38.37 
 
 		 314 aa  167  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.18 
 
 		 313 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  36.73 
 
 		 340 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  43.39 
 
 		 308 aa  166  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  39.47 
 
 		 345 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4324  extracellular solute-binding protein  41.74 
 
 		 313 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  36.94 
 
 		 355 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  41.63 
 
 		 305 aa  165  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2490  extracellular solute-binding protein family 3  42.74 
 
 		 311 aa  165  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  42.5 
 
 		 313 aa  165  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  33.82 
 
 		 345 aa  165  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  42.74 
 
 		 311 aa  164  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  37.24 
 
 		 317 aa  164  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  35.92 
 
 		 342 aa  164  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  37.24 
 
 		 317 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  37.24 
 
 		 317 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  37.39 
 
 		 315 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>