More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3728 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  100 
 
 		 376 aa  769    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  81.06 
 
 		 369 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  81.62 
 
 		 374 aa  610  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  81.1 
 
 		 371 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  80.28 
 
 		 365 aa  604  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  80.49 
 
 		 371 aa  594  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  79.3 
 
 		 372 aa  588  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  80.4 
 
 		 382 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  78.86 
 
 		 369 aa  587  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  77.09 
 
 		 366 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  78.81 
 
 		 374 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  77.03 
 
 		 374 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  73.33 
 
 		 380 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  76.23 
 
 		 367 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  77.44 
 
 		 386 aa  558  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  76.65 
 
 		 381 aa  560  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  71.51 
 
 		 387 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  73.14 
 
 		 367 aa  535  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  71.15 
 
 		 410 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  72 
 
 		 388 aa  527  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  72.75 
 
 		 377 aa  521  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  68.1 
 
 		 396 aa  521  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  74.85 
 
 		 481 aa  521  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  68.64 
 
 		 378 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  68.62 
 
 		 376 aa  514  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  71.63 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  66.57 
 
 		 396 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  38.16 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  37.75 
 
 		 734 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  36.81 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  39.58 
 
 		 357 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.86 
 
 		 365 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  36.73 
 
 		 361 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  35.75 
 
 		 374 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  34.45 
 
 		 352 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  32.84 
 
 		 351 aa  179  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  32.54 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  32.25 
 
 		 351 aa  176  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  32.25 
 
 		 352 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  31.66 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  31.66 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  31.95 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  31.95 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  31.36 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  35.13 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  32.54 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  29.79 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  29.79 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  32.07 
 
 		 330 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  32.26 
 
 		 340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  29.08 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  32.49 
 
 		 355 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  30.84 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  29.77 
 
 		 358 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  31.94 
 
 		 355 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  31.09 
 
 		 356 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  29.61 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  28 
 
 		 364 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  30.32 
 
 		 344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  28.32 
 
 		 352 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  29.19 
 
 		 358 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.09 
 
 		 345 aa  123  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  27.78 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  28.57 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  27.89 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  30.06 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  27.89 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  29.6 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  29.77 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  27.09 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  29.15 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  28.86 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  33.33 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  26.93 
 
 		 343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  26.9 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  26.81 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  28.65 
 
 		 366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  26.93 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  26.81 
 
 		 367 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  28.21 
 
 		 347 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  31.03 
 
 		 345 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  31.96 
 
 		 350 aa  109  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.33 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  31.7 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  34.69 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  31.7 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  31.7 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  23.64 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  32.28 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  24.92 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  33.85 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  24.93 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  25 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.83 
 
 		 145 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  31.11 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  26.39 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  26.1 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  24.6 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  27.05 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  29.41 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>