More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 347 aa  702    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  63.01 
 
 		 345 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  62.06 
 
 		 350 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  59.06 
 
 		 363 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  56.97 
 
 		 367 aa  401  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  56.81 
 
 		 345 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  56.89 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  55.79 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  54.91 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  55.79 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  54.68 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  54.34 
 
 		 345 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  54.97 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  50.15 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  48.7 
 
 		 352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  50.59 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  46.04 
 
 		 347 aa  302  5.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  48.28 
 
 		 354 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  48.67 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  49.42 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  43.79 
 
 		 343 aa  295  5e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  49.56 
 
 		 345 aa  292  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  45.27 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  45.48 
 
 		 340 aa  289  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  43.82 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  48.37 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  46.75 
 
 		 367 aa  280  3e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  45.8 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  44.02 
 
 		 345 aa  275  6e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  47.65 
 
 		 355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  42.86 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  45.91 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  45.93 
 
 		 348 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  46.22 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  44.03 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  45.64 
 
 		 348 aa  256  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  37.61 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  36.73 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  36.44 
 
 		 352 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  36.44 
 
 		 351 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  36.15 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  35.86 
 
 		 351 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  36.15 
 
 		 351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  36.15 
 
 		 351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  35.88 
 
 		 351 aa  223  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  38.3 
 
 		 345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  39.41 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  34.99 
 
 		 352 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  36.81 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  36.81 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.72 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  30.03 
 
 		 358 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  30.17 
 
 		 352 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.52 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  30.51 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  32.62 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  51.45 
 
 		 145 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.39 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  28.65 
 
 		 371 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  29.57 
 
 		 396 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  28.62 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  29.15 
 
 		 374 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  33.23 
 
 		 734 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  26.8 
 
 		 369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  27.75 
 
 		 374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  29 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.74 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  27.91 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  26.9 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  26.53 
 
 		 378 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 		 359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  28.82 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  28.36 
 
 		 367 aa  119  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  28.95 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  27.25 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  27.11 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  28.41 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.83 
 
 		 381 aa  115  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  26.38 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  26.16 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.91 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  26.16 
 
 		 388 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  27.59 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  29.33 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  26.33 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  26.82 
 
 		 371 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  25.21 
 
 		 410 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  25.58 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.48 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  26.07 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  27.02 
 
 		 331 aa  96.3  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  27.72 
 
 		 341 aa  95.1  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  32.9 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  27.99 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  25.54 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  26.82 
 
 		 347 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.61 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  26.63 
 
 		 364 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  26.99 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  27.01 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>