More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1930 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  100 
 
 		 371 aa  761    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  86.74 
 
 		 372 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  86.07 
 
 		 366 aa  644    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  85.52 
 
 		 369 aa  630  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  86.36 
 
 		 382 aa  632  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  83.62 
 
 		 374 aa  627  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  82.73 
 
 		 365 aa  625  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  84.64 
 
 		 371 aa  627  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  78.44 
 
 		 374 aa  616  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  78.53 
 
 		 369 aa  617  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  81.1 
 
 		 376 aa  612  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  82.6 
 
 		 381 aa  609  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  83.94 
 
 		 367 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  78.89 
 
 		 380 aa  604  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  81.06 
 
 		 386 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  78.61 
 
 		 377 aa  575  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  75.14 
 
 		 387 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  75.71 
 
 		 367 aa  567  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  79.49 
 
 		 374 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  77.52 
 
 		 388 aa  565  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  74.52 
 
 		 410 aa  559  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  71.15 
 
 		 378 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  80.12 
 
 		 481 aa  545  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  72.07 
 
 		 396 aa  546  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  73.55 
 
 		 384 aa  540  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  72.3 
 
 		 376 aa  523  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  70.2 
 
 		 396 aa  510  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  39.55 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  39.59 
 
 		 377 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  38.84 
 
 		 734 aa  225  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  39.31 
 
 		 357 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  38.27 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.39 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  38.62 
 
 		 361 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  36.03 
 
 		 352 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  36.06 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  31.29 
 
 		 351 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  30.99 
 
 		 351 aa  176  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  30.7 
 
 		 352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  30.68 
 
 		 351 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  30.09 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  30.41 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  30.41 
 
 		 351 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  30.12 
 
 		 351 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  30.12 
 
 		 351 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  31.29 
 
 		 352 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  30.32 
 
 		 353 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  30.32 
 
 		 353 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  35.2 
 
 		 355 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  30.52 
 
 		 340 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  33.24 
 
 		 356 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  30.64 
 
 		 364 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  33.63 
 
 		 355 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.94 
 
 		 345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  31.59 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  31.38 
 
 		 358 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  30.35 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  32.1 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  30.07 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  31.01 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  29.86 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  30.2 
 
 		 352 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  31.64 
 
 		 367 aa  140  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  32.17 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  30.62 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  30.35 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  30 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  26.02 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.65 
 
 		 347 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 		 345 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  29.89 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  30.52 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  29.34 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  29.65 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  30.46 
 
 		 348 aa  126  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  30.46 
 
 		 348 aa  126  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  30.72 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  29.6 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  30.97 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  28.29 
 
 		 347 aa  122  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  26.61 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  30.2 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  28.66 
 
 		 367 aa  119  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  29.14 
 
 		 347 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  33.03 
 
 		 350 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  28.4 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  24.37 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  25.56 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.71 
 
 		 145 aa  87  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  26.1 
 
 		 328 aa  86.3  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  24 
 
 		 353 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  26.19 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  34.27 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  25.64 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  24.87 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  26.19 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  26.19 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  26.09 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  25.81 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>