More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1952 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  100 
 
 		 343 aa  684    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  86.3 
 
 		 345 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  86.3 
 
 		 343 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  64.91 
 
 		 345 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  67.26 
 
 		 363 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  61.31 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  62.35 
 
 		 350 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  61.11 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  59.59 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  58.06 
 
 		 366 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  54.68 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  56.8 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  55 
 
 		 377 aa  359  5e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  46.06 
 
 		 345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  48.83 
 
 		 347 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  42.9 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  44.28 
 
 		 340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  45.45 
 
 		 352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  48.1 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  48.96 
 
 		 355 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  47.66 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  49.42 
 
 		 355 aa  279  4e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  47.21 
 
 		 356 aa  279  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  47.66 
 
 		 353 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  46.63 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  48.69 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  40.17 
 
 		 347 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  44.44 
 
 		 340 aa  271  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  41.59 
 
 		 340 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  42.2 
 
 		 344 aa  263  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  48.13 
 
 		 348 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  47.69 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  45.24 
 
 		 345 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  44.61 
 
 		 344 aa  245  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  39.83 
 
 		 364 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  40.06 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  34.01 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  39.88 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  32.86 
 
 		 351 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  33.43 
 
 		 351 aa  209  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  33.43 
 
 		 351 aa  208  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  33.43 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  32.57 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  32.57 
 
 		 352 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  32 
 
 		 351 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  32 
 
 		 351 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  37.18 
 
 		 345 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  33.14 
 
 		 352 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  32.95 
 
 		 353 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  32.95 
 
 		 353 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  33.54 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  34.17 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  34.18 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  32.85 
 
 		 358 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  33.86 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.4 
 
 		 365 aa  145  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.4 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  30.99 
 
 		 378 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  33.96 
 
 		 734 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  33.75 
 
 		 377 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  31.12 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  32.21 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.5 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  29.65 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  45.32 
 
 		 145 aa  127  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  30.06 
 
 		 380 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  29.65 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  30.92 
 
 		 374 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  30.84 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  31.29 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  30.61 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  30.35 
 
 		 369 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  27.91 
 
 		 369 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  30.17 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.67 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  29.12 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  27.35 
 
 		 374 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  29.19 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.78 
 
 		 366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.77 
 
 		 381 aa  112  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 		 410 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  29.41 
 
 		 386 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  31.7 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  29.65 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  30.58 
 
 		 481 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  27.94 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  34.38 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  30.26 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  26.8 
 
 		 331 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  31.09 
 
 		 356 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  24.06 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  29.34 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  25.86 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.51 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  29.94 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  26.74 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  28.09 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  34.78 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  27.57 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  25.22 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>