More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2006 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  100 
 
 		 377 aa  771    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  79.6 
 
 		 371 aa  589  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  79.04 
 
 		 374 aa  579  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  76.94 
 
 		 366 aa  570  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  75.28 
 
 		 365 aa  565  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  72.68 
 
 		 380 aa  564  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  77.69 
 
 		 371 aa  565  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  74.73 
 
 		 381 aa  559  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  78.53 
 
 		 372 aa  558  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  76.94 
 
 		 369 aa  560  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  77.12 
 
 		 382 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  75 
 
 		 367 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  71.07 
 
 		 369 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  72.86 
 
 		 388 aa  539  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  72.75 
 
 		 376 aa  536  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  70.22 
 
 		 374 aa  534  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  70.57 
 
 		 367 aa  531  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  70.9 
 
 		 387 aa  531  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  70.03 
 
 		 410 aa  528  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  70.7 
 
 		 396 aa  526  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  68.87 
 
 		 386 aa  511  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  69.25 
 
 		 374 aa  508  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  67.82 
 
 		 376 aa  496  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  63.35 
 
 		 378 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  67.88 
 
 		 384 aa  484  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  71.43 
 
 		 481 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  64.23 
 
 		 396 aa  459  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  37.32 
 
 		 377 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  37.03 
 
 		 734 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  35.22 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  36.26 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.76 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  35.73 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 374 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  35.09 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  30.81 
 
 		 340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  28.91 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  29.5 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  28.91 
 
 		 351 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  32.2 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  28.61 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  30.64 
 
 		 364 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  33.24 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  28.02 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  28.02 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  28.32 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  28.61 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  30.64 
 
 		 345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  29.5 
 
 		 352 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  29.14 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  32.75 
 
 		 355 aa  142  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  33.14 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 		 344 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  27.94 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  27.94 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.27 
 
 		 345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  31.91 
 
 		 349 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  30.86 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  31.07 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  27.86 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  29.82 
 
 		 358 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  28.92 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  30.06 
 
 		 348 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  29.36 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  26.24 
 
 		 344 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  29.33 
 
 		 342 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  29.77 
 
 		 348 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  28.94 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  30.09 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  30.64 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.99 
 
 		 347 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  29.19 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  28 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  30.61 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  28.82 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  26.55 
 
 		 345 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  27.07 
 
 		 347 aa  123  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  28.49 
 
 		 345 aa  123  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  29.15 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  28.65 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  29.39 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  29.86 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  29.57 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  28.19 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  29.6 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  25.5 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  23.48 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.13 
 
 		 145 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  24.25 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  32.42 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  24.77 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  31.49 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  24.7 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  22.93 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  24.61 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  31.36 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  26.11 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  31.67 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>