More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0703 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  100 
 
 		 378 aa  780    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  71.79 
 
 		 371 aa  554  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  67.48 
 
 		 369 aa  549  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  73.52 
 
 		 372 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  69.75 
 
 		 365 aa  544  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  69.49 
 
 		 374 aa  541  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  70.94 
 
 		 366 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  69.97 
 
 		 382 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  69.01 
 
 		 374 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  70.62 
 
 		 371 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  68.44 
 
 		 381 aa  522  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  68.64 
 
 		 376 aa  518  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  70.06 
 
 		 369 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  65.25 
 
 		 380 aa  508  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  70.86 
 
 		 384 aa  510  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  66.67 
 
 		 367 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  65.43 
 
 		 367 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  66.29 
 
 		 388 aa  503  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  65.87 
 
 		 386 aa  501  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  66.05 
 
 		 374 aa  500  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  61.9 
 
 		 387 aa  492  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  70.5 
 
 		 481 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  63.23 
 
 		 410 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  65.72 
 
 		 396 aa  489  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  62.08 
 
 		 396 aa  480  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  64.81 
 
 		 376 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  63.35 
 
 		 377 aa  478  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  38.92 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  37.9 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  36.31 
 
 		 734 aa  225  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  38.15 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  37.05 
 
 		 374 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.31 
 
 		 365 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  36.81 
 
 		 349 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  33.24 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  32.94 
 
 		 351 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  34.24 
 
 		 352 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  32.65 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  32.65 
 
 		 351 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  32.65 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  32.36 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  32.36 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  31.49 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  30.61 
 
 		 351 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  32.65 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  36.34 
 
 		 355 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  33.82 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  31.96 
 
 		 364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  31.4 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  35.09 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  30.52 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  30.52 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  32.86 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  32.58 
 
 		 367 aa  153  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  28.32 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  30.36 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  29.51 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  29.65 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  29.72 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.76 
 
 		 345 aa  143  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  30.97 
 
 		 342 aa  143  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  32.07 
 
 		 343 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  31.16 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  32.07 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  31.5 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  29.82 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  28.99 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  28.74 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  30.99 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  28.37 
 
 		 345 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  29.43 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  28.99 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  29.19 
 
 		 345 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  28.86 
 
 		 340 aa  135  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  29.03 
 
 		 367 aa  135  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  29.97 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  27.7 
 
 		 345 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  30.75 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  30.72 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  29.34 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  30.46 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  28.65 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  25.92 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  28.2 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.53 
 
 		 347 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  28.74 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  25.36 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  25.39 
 
 		 331 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  22.48 
 
 		 353 aa  86.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  24.72 
 
 		 362 aa  86.3  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  35.45 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  26.41 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  28.14 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.4 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  23.41 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.96 
 
 		 145 aa  80.9  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2076  luciferase-like  25 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  25.15 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  25.15 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>