More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28920 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
387 aa  800    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  77.09 
 
 
365 aa  586  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  72.06 
 
 
380 aa  581  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  75.33 
 
 
381 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  73.9 
 
 
374 aa  575  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  74.29 
 
 
369 aa  574  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  75.49 
 
 
366 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  76.07 
 
 
371 aa  569  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  76.64 
 
 
382 aa  569  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  75.42 
 
 
374 aa  569  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  71.61 
 
 
410 aa  567  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  76.84 
 
 
369 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  70.94 
 
 
388 aa  557  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  74.72 
 
 
374 aa  542  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  73.08 
 
 
372 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  73.74 
 
 
371 aa  538  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  71.51 
 
 
376 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  72.91 
 
 
367 aa  535  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  71.71 
 
 
396 aa  536  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  70.63 
 
 
376 aa  530  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  72.93 
 
 
386 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  70.32 
 
 
367 aa  522  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  70.9 
 
 
377 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  66.06 
 
 
384 aa  509  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  61.9 
 
 
378 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  62.07 
 
 
396 aa  473  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  69.25 
 
 
481 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  36.77 
 
 
359 aa  229  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  37.43 
 
 
357 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  37.9 
 
 
377 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  37.03 
 
 
734 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  36.44 
 
 
352 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  36.71 
 
 
361 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.18 
 
 
365 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  35.73 
 
 
374 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  33.33 
 
 
351 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
351 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  33.04 
 
 
351 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  33.04 
 
 
352 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  33.04 
 
 
351 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  31.86 
 
 
351 aa  186  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  32.75 
 
 
351 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  32.75 
 
 
351 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  32.16 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  34.78 
 
 
349 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  33.8 
 
 
364 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  33.04 
 
 
352 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  35.9 
 
 
355 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  32.68 
 
 
356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  32.75 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  33.72 
 
 
345 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  33.52 
 
 
349 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
355 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  32.48 
 
 
352 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  29.15 
 
 
353 aa  159  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  29.15 
 
 
353 aa  159  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  33.8 
 
 
367 aa  159  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  30.17 
 
 
358 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  33.04 
 
 
344 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  30.95 
 
 
354 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.72 
 
 
347 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  29.94 
 
 
345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  30.95 
 
 
353 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  30.72 
 
 
340 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  28.74 
 
 
340 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  32.28 
 
 
330 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  31.9 
 
 
347 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 
344 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  30.81 
 
 
358 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  30.97 
 
 
342 aa  149  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  29.71 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  32.56 
 
 
348 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  30.43 
 
 
345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  31.14 
 
 
366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  31.82 
 
 
345 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.1 
 
 
345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  31.53 
 
 
343 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  32.28 
 
 
348 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  31.4 
 
 
343 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  30.35 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  29.39 
 
 
345 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  28.7 
 
 
345 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  27.78 
 
 
343 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  29.36 
 
 
377 aa  133  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  28.03 
 
 
350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 
367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  29.51 
 
 
363 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  25.62 
 
 
362 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.86 
 
 
145 aa  100  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  24.86 
 
 
374 aa  97.1  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  27.19 
 
 
328 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  25.32 
 
 
331 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  25.91 
 
 
363 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  25.91 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  24.78 
 
 
334 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  23.17 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  31.67 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  25.36 
 
 
334 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  25.82 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>