More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6837 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
345 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  67.93 
 
 
344 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  66.86 
 
 
348 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  66.86 
 
 
348 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  60.88 
 
 
340 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  57.18 
 
 
342 aa  391  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  57.94 
 
 
340 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  57.18 
 
 
340 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  54.71 
 
 
355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  55.39 
 
 
367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  48.98 
 
 
352 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  55.69 
 
 
355 aa  323  3e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  51.6 
 
 
356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  50.14 
 
 
354 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  52.41 
 
 
377 aa  318  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  52.92 
 
 
345 aa  316  4e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  46.94 
 
 
345 aa  315  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  48.7 
 
 
353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  47.06 
 
 
350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  48.66 
 
 
367 aa  309  4e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  49.71 
 
 
347 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.8 
 
 
347 aa  292  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  46.76 
 
 
345 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  43.9 
 
 
344 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  40.7 
 
 
343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  46.06 
 
 
363 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  44.41 
 
 
358 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  46.42 
 
 
349 aa  278  8e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  44.71 
 
 
345 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  43.93 
 
 
366 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  40.47 
 
 
347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.99 
 
 
345 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  43.1 
 
 
364 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  45.24 
 
 
343 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  43.02 
 
 
343 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  43.02 
 
 
345 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  43.27 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  39.53 
 
 
345 aa  225  8e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  36.55 
 
 
351 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  36.26 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  36.26 
 
 
352 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  35.76 
 
 
351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  35.17 
 
 
351 aa  219  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  35.17 
 
 
351 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  35.67 
 
 
351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  35.67 
 
 
351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  35.17 
 
 
351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  35.47 
 
 
352 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  37.97 
 
 
353 aa  203  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  37.97 
 
 
353 aa  203  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  33.43 
 
 
358 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  30.75 
 
 
357 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  37.85 
 
 
734 aa  165  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  31.34 
 
 
361 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  30.45 
 
 
359 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  31.2 
 
 
374 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.43 
 
 
387 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  31.7 
 
 
396 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  36.84 
 
 
377 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  29.57 
 
 
365 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  31.01 
 
 
367 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  29.86 
 
 
371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  31.2 
 
 
388 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  31.08 
 
 
377 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  28.82 
 
 
369 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  29.28 
 
 
380 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  29.19 
 
 
378 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  30.77 
 
 
352 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  29.57 
 
 
374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  29.71 
 
 
349 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.86 
 
 
381 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.57 
 
 
366 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  28.36 
 
 
374 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.79 
 
 
365 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  28.45 
 
 
382 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  29.57 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  29.82 
 
 
410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  29.57 
 
 
369 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  30.22 
 
 
481 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  28.7 
 
 
386 aa  135  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  30.06 
 
 
376 aa  132  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  27.78 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  28.7 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  27.54 
 
 
367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.96 
 
 
396 aa  129  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.19 
 
 
384 aa  126  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  27.78 
 
 
374 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.97 
 
 
145 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  30.45 
 
 
353 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.86 
 
 
362 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
352 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  26.39 
 
 
354 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  25.61 
 
 
362 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  28.24 
 
 
364 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  25.61 
 
 
362 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  26.89 
 
 
346 aa  89.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  28.3 
 
 
331 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  30.52 
 
 
6889 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  31.34 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  26.54 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>