More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2321 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  100 
 
 
362 aa  740    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
362 aa  740    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  55.22 
 
 
364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  48.18 
 
 
365 aa  342  4e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  36.31 
 
 
439 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  32.25 
 
 
386 aa  185  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  32.58 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  35.77 
 
 
436 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  35.77 
 
 
436 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  35.77 
 
 
436 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  35.5 
 
 
439 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  32.53 
 
 
402 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  33.6 
 
 
415 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  31.34 
 
 
374 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  34.92 
 
 
355 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  32.6 
 
 
372 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  29.3 
 
 
383 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  30.33 
 
 
377 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  37.44 
 
 
362 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  28.12 
 
 
387 aa  150  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  31.92 
 
 
352 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  31.49 
 
 
331 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  30.64 
 
 
384 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  30.64 
 
 
384 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
352 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  30.64 
 
 
384 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  30.06 
 
 
352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  29.74 
 
 
354 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  26.33 
 
 
382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  29.13 
 
 
358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  29.94 
 
 
358 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  28.93 
 
 
347 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  27.35 
 
 
353 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  40.83 
 
 
345 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  28.41 
 
 
363 aa  122  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  28.53 
 
 
371 aa  122  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  36.13 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  36.65 
 
 
347 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  27.42 
 
 
347 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  28.33 
 
 
346 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  24.29 
 
 
341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.41 
 
 
346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  29.05 
 
 
354 aa  119  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  28.69 
 
 
355 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  28.37 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  29.14 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  28.3 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  26.69 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  27.35 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  28.09 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  37.82 
 
 
354 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  27.35 
 
 
346 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  33.68 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  26.83 
 
 
345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  28.1 
 
 
342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  34.87 
 
 
345 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  26.04 
 
 
362 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  34.31 
 
 
343 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  35.68 
 
 
329 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  31.84 
 
 
343 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  26.29 
 
 
345 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  34.39 
 
 
363 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  29.55 
 
 
330 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  26.37 
 
 
364 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  26.63 
 
 
421 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  31.63 
 
 
327 aa  99.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  25.82 
 
 
361 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  27.91 
 
 
365 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  28.08 
 
 
333 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  27.3 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  41.26 
 
 
324 aa  97.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  32.46 
 
 
333 aa  97.1  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  28.41 
 
 
345 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  29.16 
 
 
356 aa  96.3  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  40.48 
 
 
341 aa  96.3  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  26.92 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  26.93 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  39.04 
 
 
321 aa  94.4  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  25.13 
 
 
344 aa  93.2  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  28.21 
 
 
330 aa  92.8  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  27.79 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  38.36 
 
 
321 aa  92  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  27.07 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  34.52 
 
 
323 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  21.61 
 
 
355 aa  90.9  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  25.67 
 
 
366 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.73 
 
 
372 aa  90.5  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  26.47 
 
 
334 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  25.28 
 
 
354 aa  89.4  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  29.94 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  38.41 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  42.16 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  38.41 
 
 
344 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  34.93 
 
 
308 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  27.2 
 
 
438 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  26.65 
 
 
340 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  34.93 
 
 
308 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  41.18 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>