More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4827 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  100 
 
 		 352 aa  705    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  53.87 
 
 		 374 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  52.29 
 
 		 357 aa  361  9e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  52.33 
 
 		 361 aa  348  7e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  51.43 
 
 		 359 aa  348  7e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  45.58 
 
 		 349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.82 
 
 		 365 aa  269  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  44.32 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  43.3 
 
 		 734 aa  259  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.44 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  36.03 
 
 		 371 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  38.78 
 
 		 396 aa  202  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  35.16 
 
 		 369 aa  202  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  35.17 
 
 		 374 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  35.29 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.92 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  34.99 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  36.45 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  34.92 
 
 		 365 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  34.45 
 
 		 376 aa  186  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  34.24 
 
 		 378 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.59 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  36.89 
 
 		 481 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  33.61 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  34.94 
 
 		 410 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  34.36 
 
 		 372 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  34.45 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  33.89 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  35.83 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.36 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  35.13 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  33.04 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.39 
 
 		 384 aa  172  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  33.23 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  34.55 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  32.16 
 
 		 351 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  31.87 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  33.61 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  33.89 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  31.58 
 
 		 351 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  31.87 
 
 		 351 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  31.87 
 
 		 352 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  31.29 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  31.29 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  35.65 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  33.62 
 
 		 376 aa  159  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  34.74 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  35.35 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  31.87 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  31.64 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  33.33 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  34.56 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  28.48 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  33.54 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  31.7 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.53 
 
 		 345 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  34.69 
 
 		 345 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  32.74 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  33.62 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  33.62 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  30.85 
 
 		 356 aa  143  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  30.7 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  28.44 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  30.72 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.17 
 
 		 347 aa  139  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  30.77 
 
 		 345 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  30.84 
 
 		 364 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  32.5 
 
 		 367 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  28.99 
 
 		 358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  32.56 
 
 		 355 aa  135  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  29.67 
 
 		 344 aa  135  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  33.93 
 
 		 355 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  32.37 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  32.42 
 
 		 350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  30 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  30 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  30.31 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  31.48 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  28.65 
 
 		 354 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  32.71 
 
 		 349 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  29.63 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  32.55 
 
 		 367 aa  126  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  29.68 
 
 		 345 aa  125  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  30.99 
 
 		 347 aa  125  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  31.67 
 
 		 348 aa  119  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  31.09 
 
 		 348 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  25.63 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  29.87 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  29.66 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  31.41 
 
 		 327 aa  99.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.95 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  28.89 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  26.55 
 
 		 363 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  32.29 
 
 		 352 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  26.47 
 
 		 374 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  29.5 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  27.55 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  28.48 
 
 		 345 aa  92.8  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  25.32 
 
 		 331 aa  89.7  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>