More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3263 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  100 
 
 
327 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  57.59 
 
 
343 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  55.96 
 
 
329 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  42.73 
 
 
333 aa  275  7e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  39.7 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  42 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  40.66 
 
 
330 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  34.63 
 
 
353 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  30.9 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  42.22 
 
 
352 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  34.56 
 
 
364 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  27.79 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  33.17 
 
 
362 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  32.15 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  34.47 
 
 
356 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  39.88 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  39.26 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  36.48 
 
 
355 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  26.96 
 
 
347 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  27.03 
 
 
346 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  32.05 
 
 
380 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  32.92 
 
 
345 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  36.02 
 
 
352 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  26.45 
 
 
346 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  26.45 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  27.3 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  29.34 
 
 
335 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  29.39 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  30.15 
 
 
342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  28.22 
 
 
334 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  32.17 
 
 
344 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  32.72 
 
 
346 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  32.17 
 
 
344 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  32.82 
 
 
364 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  37.97 
 
 
323 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  33.8 
 
 
365 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  26 
 
 
345 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  36.56 
 
 
348 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  25.77 
 
 
347 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  32.72 
 
 
372 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  31.09 
 
 
341 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  32.75 
 
 
386 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  30.32 
 
 
371 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  24.71 
 
 
345 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  29.6 
 
 
363 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  25.85 
 
 
355 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  33.12 
 
 
341 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  31.04 
 
 
341 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  28.86 
 
 
413 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  29.01 
 
 
347 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  30.82 
 
 
405 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  32.49 
 
 
389 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  32.63 
 
 
342 aa  99.8  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  31.41 
 
 
352 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  31.63 
 
 
362 aa  99.4  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  31.78 
 
 
376 aa  99.4  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  31.63 
 
 
362 aa  99.4  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  31.27 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  33.06 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  30.86 
 
 
343 aa  97.4  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  35.8 
 
 
383 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  37.14 
 
 
346 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  34.98 
 
 
354 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  30.59 
 
 
362 aa  95.9  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  29.11 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  29.63 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  33.82 
 
 
354 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  30.29 
 
 
345 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  28.27 
 
 
331 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  30.55 
 
 
734 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 
357 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  29.22 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  35.43 
 
 
379 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  28.88 
 
 
360 aa  92.8  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  27.59 
 
 
361 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  35.94 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  26.85 
 
 
415 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  32.99 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  35.84 
 
 
358 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  29.14 
 
 
377 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  35.39 
 
 
377 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  34.29 
 
 
387 aa  89.7  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  36.75 
 
 
334 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  25.98 
 
 
364 aa  89.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  32.71 
 
 
363 aa  89.7  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  37.57 
 
 
361 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  29.11 
 
 
353 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  31.44 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  28.8 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  31.44 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  29.02 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  32.86 
 
 
324 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  29.81 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  36.22 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  36.22 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  32.84 
 
 
366 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  31.44 
 
 
349 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  31 
 
 
439 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  31.12 
 
 
358 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  29.63 
 
 
391 aa  85.9  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>