More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4901 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  100 
 
 		 341 aa  670    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  60.54 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  60.71 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  60.3 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  60.55 
 
 		 345 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  60.42 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  60.12 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  59.33 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  60.98 
 
 		 376 aa  361  8e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  58.36 
 
 		 343 aa  343  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  56.97 
 
 		 372 aa  315  5e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  54.79 
 
 		 405 aa  302  6.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  30.64 
 
 		 346 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  30.6 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  26.45 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  29.69 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  33.12 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  29.63 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  41.53 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  34.81 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  30.48 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  33.81 
 
 		 381 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  31.31 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  30.65 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  45.95 
 
 		 365 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  33.68 
 
 		 355 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  40.48 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  40.48 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  32.23 
 
 		 342 aa  96.3  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  30.91 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  31.69 
 
 		 355 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  30.09 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 372 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  31.25 
 
 		 361 aa  94  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  28.21 
 
 		 341 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.8 
 
 		 353 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  40 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  32.19 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  47.42 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  37.01 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  29.87 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  37.59 
 
 		 382 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  39.82 
 
 		 383 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  29.74 
 
 		 362 aa  89.7  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  31.03 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  28.93 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  29.41 
 
 		 380 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  45.16 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  28.37 
 
 		 402 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  37.82 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  31.52 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.29 
 
 		 354 aa  86.7  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  29.97 
 
 		 329 aa  86.7  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  37.1 
 
 		 387 aa  86.3  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.82 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  28.33 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  29.09 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  39.68 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  29.54 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  27.71 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  30.95 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  29.32 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  32.43 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  28.75 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  34.68 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  35.33 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  41.75 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  34.76 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  29.04 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  27.25 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  29.97 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  29.15 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  30.74 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  40.59 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  38.17 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  37.59 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  28.74 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.82 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  25.94 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  28.79 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  43.16 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  30.2 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  33.87 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  35.66 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  28.11 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  33.87 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  33.87 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  33.87 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  42.28 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  36 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  28.74 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  31.21 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  27.66 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  27.66 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  36.29 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  43.75 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  29.85 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3897  luciferase family protein  27.96 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>