More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2397 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 341 aa  676    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  72.27 
 
 		 337 aa  478  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  68.91 
 
 		 341 aa  477  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  70.97 
 
 		 338 aa  471  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  67.53 
 
 		 350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  67.36 
 
 		 338 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  48.67 
 
 		 359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  45.97 
 
 		 346 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  50 
 
 		 344 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  46.27 
 
 		 372 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  47.75 
 
 		 342 aa  271  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  47.31 
 
 		 341 aa  269  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  47.66 
 
 		 331 aa  260  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  33.52 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  32.75 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  31.99 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  33.52 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  30.77 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  28.98 
 
 		 340 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  30.75 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  30.29 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  29.97 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  29.06 
 
 		 340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  29.6 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  31.29 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  29.55 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  31.09 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.06 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  31.79 
 
 		 361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.47 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  31.25 
 
 		 344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  30.62 
 
 		 340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  29.68 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  29.68 
 
 		 341 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.78 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  29.83 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  29.55 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  35.77 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  28.29 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  30.06 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  28.16 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  31.92 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  32.2 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  27.3 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  28.74 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  27.93 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  32.56 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  32.76 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  30.48 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  30.7 
 
 		 405 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.04 
 
 		 372 aa  97.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  32.3 
 
 		 258 aa  96.7  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  30.37 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  30.17 
 
 		 348 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  31.01 
 
 		 348 aa  92.4  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  29.46 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  30.93 
 
 		 355 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  33.6 
 
 		 358 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  44.44 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  30.59 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  34.46 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  31.48 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  42.99 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.99 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  35.53 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  29.58 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  33.68 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  29.8 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  27.78 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  31.15 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  31.15 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  45.68 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  38.68 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  23.76 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  37.11 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  27.17 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  31.16 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  29.21 
 
 		 363 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  32.3 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  43.53 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  40 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  34.95 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  38.54 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  27.17 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  31.2 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  26.88 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  31.72 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  37.61 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  25.98 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  27.03 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  35.52 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  24.14 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  24.72 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  30 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  27.03 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  34.88 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  27.03 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  37.23 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  35.11 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>