More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2931 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  100 
 
 
348 aa  703    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  89.41 
 
 
340 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  89.12 
 
 
340 aa  624  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  86.18 
 
 
340 aa  607  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  84.5 
 
 
344 aa  605  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  84.12 
 
 
341 aa  597  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  82.94 
 
 
340 aa  595  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  83.82 
 
 
341 aa  595  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  84.12 
 
 
338 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  83.24 
 
 
340 aa  597  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  81.76 
 
 
340 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  80.29 
 
 
340 aa  575  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  81.18 
 
 
344 aa  573  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  79.41 
 
 
340 aa  568  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  76.4 
 
 
340 aa  537  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  73.53 
 
 
340 aa  528  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  72.35 
 
 
340 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  72.65 
 
 
340 aa  518  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  74.26 
 
 
338 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  76.18 
 
 
341 aa  511  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  73.9 
 
 
338 aa  511  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  71.3 
 
 
340 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  62.39 
 
 
344 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  61.95 
 
 
345 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  59.71 
 
 
341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  59.94 
 
 
361 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  55.1 
 
 
354 aa  358  6e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  48.27 
 
 
355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  53.82 
 
 
274 aa  250  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  47.67 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  33.52 
 
 
350 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  31.9 
 
 
359 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  32.93 
 
 
361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.45 
 
 
365 aa  146  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  31.32 
 
 
372 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  33.05 
 
 
341 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  30.2 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  29.81 
 
 
342 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  27.71 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  30.68 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  28.1 
 
 
338 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  31.25 
 
 
381 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  29.19 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  31.1 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  28.77 
 
 
338 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  33.15 
 
 
347 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  29.68 
 
 
331 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  31.53 
 
 
348 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  30.98 
 
 
376 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06220  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  54.76 
 
 
127 aa  93.2  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  29.57 
 
 
345 aa  89.7  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  29.64 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 
344 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  29.67 
 
 
344 aa  85.9  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  30.94 
 
 
348 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.15 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  30.33 
 
 
341 aa  84  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  29.05 
 
 
405 aa  79.3  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  29.07 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  29.96 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  30.25 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  30.25 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  31.1 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  27.6 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  36.79 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  26.67 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  26.24 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.07 
 
 
347 aa  67  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  41.05 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  39.36 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  27.75 
 
 
361 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  29.9 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  40.48 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  45.71 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  31.58 
 
 
339 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  28.03 
 
 
345 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  32.42 
 
 
386 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  36.56 
 
 
329 aa  63.5  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  26.98 
 
 
360 aa  63.2  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  32.71 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  37.35 
 
 
352 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0292  Luciferase-like monooxygenase  42.99 
 
 
448 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.313138 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  23.27 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  35.29 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  24.65 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  34.92 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  33.63 
 
 
334 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  42.86 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  33.63 
 
 
334 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  34.21 
 
 
333 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  32.28 
 
 
345 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  31.69 
 
 
389 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  43.04 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  31.69 
 
 
389 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  32.28 
 
 
343 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  42.5 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  33.58 
 
 
343 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  33.06 
 
 
328 aa  60.1  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  40.54 
 
 
330 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>