More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6664 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
340 aa  699    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  88.53 
 
 
340 aa  625  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  82.35 
 
 
340 aa  598  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  76.18 
 
 
340 aa  545  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  77.35 
 
 
340 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  77.06 
 
 
340 aa  544  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  75.29 
 
 
340 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  75.29 
 
 
341 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  76.47 
 
 
338 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  74.12 
 
 
340 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  73.82 
 
 
344 aa  534  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  74.71 
 
 
341 aa  537  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  75.59 
 
 
340 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  74.12 
 
 
340 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  75 
 
 
340 aa  529  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  73.24 
 
 
344 aa  524  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  73.53 
 
 
348 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  71.6 
 
 
338 aa  496  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  69.12 
 
 
338 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  67.85 
 
 
340 aa  475  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  70.88 
 
 
341 aa  474  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  66.28 
 
 
340 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  56.03 
 
 
341 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  58.06 
 
 
344 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  57.1 
 
 
345 aa  388  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  58.48 
 
 
361 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  52.33 
 
 
354 aa  349  5e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  44.77 
 
 
355 aa  298  9e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  49.24 
 
 
274 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  46.12 
 
 
258 aa  206  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  30.52 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  30.4 
 
 
350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
372 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  31.33 
 
 
361 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  30.17 
 
 
341 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  27.83 
 
 
346 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  29.6 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  29.63 
 
 
344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.89 
 
 
365 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  28.53 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  27.74 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  29.94 
 
 
381 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  27.95 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  23.93 
 
 
338 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  28.57 
 
 
331 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  25.66 
 
 
337 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  29.7 
 
 
347 aa  99.4  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  30.25 
 
 
348 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  28.44 
 
 
376 aa  95.9  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06220  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  52.44 
 
 
127 aa  89  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  28.4 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  29.82 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  27.32 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  30.49 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.09 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  27.89 
 
 
344 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  37.98 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  27.08 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  25.77 
 
 
405 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  30.15 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  26.91 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  26.91 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  30 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  41 
 
 
344 aa  72.4  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  30.32 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  25.69 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  32.81 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.46 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  30.95 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  45.57 
 
 
335 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  32.95 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  31.78 
 
 
333 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  28.8 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  24.14 
 
 
329 aa  63.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  40 
 
 
334 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  42.31 
 
 
342 aa  63.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  36.84 
 
 
352 aa  63.2  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  35.48 
 
 
352 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  44.59 
 
 
327 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  34.74 
 
 
323 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  28.19 
 
 
355 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  40 
 
 
334 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  29.82 
 
 
353 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  33.72 
 
 
355 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  30.56 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  23.81 
 
 
345 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  23.7 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1595  luciferase-like monooxygenase  37.36 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.823817  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  33.05 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2092  luciferase family protein  34.34 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  35.56 
 
 
380 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  27.37 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  27.93 
 
 
363 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  28.57 
 
 
389 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  28.57 
 
 
389 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  27.37 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  26.44 
 
 
347 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  23.64 
 
 
345 aa  57.4  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  29.09 
 
 
347 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  24.39 
 
 
345 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>