More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0500 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 340 aa  698    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  88.53 
 
 		 340 aa  625  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  84.12 
 
 		 340 aa  598  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  77.94 
 
 		 340 aa  548  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  78.24 
 
 		 340 aa  550  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  76.76 
 
 		 340 aa  545  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  75.88 
 
 		 340 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  74.71 
 
 		 340 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  74.41 
 
 		 340 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  74.12 
 
 		 344 aa  525  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  74.12 
 
 		 344 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  75.59 
 
 		 340 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  73.53 
 
 		 341 aa  522  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  74.41 
 
 		 338 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  72.35 
 
 		 341 aa  519  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  73.53 
 
 		 340 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  71.89 
 
 		 338 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  72.65 
 
 		 348 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  70.59 
 
 		 338 aa  488  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  71.76 
 
 		 341 aa  482  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  66.96 
 
 		 340 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  68.04 
 
 		 340 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  58.06 
 
 		 341 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  59.24 
 
 		 344 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  57.1 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  58.77 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  52.19 
 
 		 354 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  45.06 
 
 		 355 aa  296  5e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  50 
 
 		 274 aa  233  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  44.72 
 
 		 258 aa  195  8.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  33.33 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  32.29 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  30.35 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 372 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  30.4 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  27.46 
 
 		 346 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  29.06 
 
 		 341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  28.77 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  29.34 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.48 
 
 		 365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  25.84 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  26.84 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  25.71 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  29.77 
 
 		 381 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  29.11 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  31.35 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  29.36 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06220  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  53.57 
 
 		 127 aa  92.4  9e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  28.53 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  28.48 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  29.48 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  27.81 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  28.18 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  27.22 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  31.38 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  30.49 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  26.69 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  26.43 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  31.08 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  26.22 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  26.22 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  27.84 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.89 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.85 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  24.77 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  26.14 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  28.24 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  35.66 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  26.67 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  25.99 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  32.46 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  32.71 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  31.53 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  30.56 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  26.19 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.65 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  44.3 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  32.29 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  39.29 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  29.69 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.46 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  38.14 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1595  luciferase-like monooxygenase  37.36 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.823817  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  25.41 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  44.59 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  26.4 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.23 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  31.48 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  24.14 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  32.73 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  27.14 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  25.42 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  41.56 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  26 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  29.35 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  33.68 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  33.73 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  38.82 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20270  hypothetical protein  63.16 
 
 		 58 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0458549  normal  0.306219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>