More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0388 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  100 
 
 
365 aa  739    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  55.22 
 
 
364 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  48.18 
 
 
362 aa  335  5e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  48.18 
 
 
362 aa  335  5e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  33.52 
 
 
380 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  27.69 
 
 
387 aa  172  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
362 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
379 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  30.47 
 
 
439 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  29.64 
 
 
436 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  31.75 
 
 
372 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  29.64 
 
 
436 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  29.64 
 
 
436 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  34.83 
 
 
355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  30.85 
 
 
439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  32.17 
 
 
415 aa  162  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  34.71 
 
 
352 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  31.05 
 
 
386 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  30.67 
 
 
374 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  33.7 
 
 
345 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  27.2 
 
 
383 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  32.71 
 
 
331 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  30.95 
 
 
402 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  27.03 
 
 
382 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  31.58 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  28.61 
 
 
377 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  27.43 
 
 
355 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  29.89 
 
 
362 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  27.46 
 
 
353 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  29.59 
 
 
376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  28.95 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  29.83 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  29.29 
 
 
354 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  29.74 
 
 
363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  28.74 
 
 
358 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  29.89 
 
 
358 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  27.37 
 
 
347 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  28.81 
 
 
352 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  28.57 
 
 
346 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  27.2 
 
 
347 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  25.65 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  27.02 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  25.36 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  25.36 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  29.36 
 
 
346 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  26.46 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  27.86 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  27.5 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  43.64 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  29.09 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  29.12 
 
 
346 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  26.46 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  29.31 
 
 
334 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  27 
 
 
346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  29.09 
 
 
346 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  26.33 
 
 
345 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  29.57 
 
 
334 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  25 
 
 
353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  29.36 
 
 
354 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  30.38 
 
 
340 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  29.91 
 
 
308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  30.19 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  26.83 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  30.19 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  35.67 
 
 
413 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  30.45 
 
 
345 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  32.54 
 
 
333 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  26.52 
 
 
328 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  24.77 
 
 
333 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  34.34 
 
 
330 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3635  alkanal monooxygenase  28.21 
 
 
356 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  33.8 
 
 
327 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  32.09 
 
 
343 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  34.18 
 
 
363 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  27.9 
 
 
355 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  22.63 
 
 
341 aa  105  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  28.32 
 
 
328 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  27.62 
 
 
345 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  30.63 
 
 
342 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  31.61 
 
 
364 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  27.74 
 
 
3337 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  27.01 
 
 
391 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  28.87 
 
 
329 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  27.94 
 
 
389 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  26.4 
 
 
360 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  26.06 
 
 
344 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
336 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  29.33 
 
 
388 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  27.3 
 
 
362 aa  99.4  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  32.2 
 
 
361 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  26.09 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  28.89 
 
 
387 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  28.68 
 
 
356 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  45.95 
 
 
341 aa  96.7  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  37.57 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  34.34 
 
 
307 aa  96.3  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  35.93 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  36.81 
 
 
396 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  26.7 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>