More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3121 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  100 
 
 
340 aa  694    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  84.12 
 
 
341 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  83.82 
 
 
341 aa  600  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  83.53 
 
 
340 aa  597  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  82.65 
 
 
340 aa  591  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  82.65 
 
 
340 aa  590  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  81.76 
 
 
340 aa  586  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  82.65 
 
 
340 aa  585  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  81.47 
 
 
340 aa  584  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  80.59 
 
 
344 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  82.35 
 
 
338 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  80.59 
 
 
340 aa  571  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  80.29 
 
 
348 aa  555  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  76.76 
 
 
344 aa  548  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  75.59 
 
 
340 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  74.41 
 
 
340 aa  534  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  75.59 
 
 
340 aa  527  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  74.85 
 
 
338 aa  522  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  73.45 
 
 
340 aa  510  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  73.24 
 
 
338 aa  508  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  73.53 
 
 
341 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  70.67 
 
 
340 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  63.05 
 
 
344 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  58.24 
 
 
341 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  61.99 
 
 
361 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  58.58 
 
 
345 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  52.77 
 
 
354 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  46.8 
 
 
355 aa  300  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  51.53 
 
 
274 aa  239  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  48.78 
 
 
258 aa  203  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  32.01 
 
 
361 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.33 
 
 
365 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  29.36 
 
 
359 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  29.39 
 
 
372 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  31.28 
 
 
350 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  28.24 
 
 
346 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  29.48 
 
 
341 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  30.06 
 
 
341 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  29 
 
 
342 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  29.11 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  30.75 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  27.53 
 
 
338 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  28.7 
 
 
344 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  32.77 
 
 
337 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  28 
 
 
338 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  31.08 
 
 
347 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  26.59 
 
 
331 aa  94  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06220  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  53.57 
 
 
127 aa  93.2  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  29.25 
 
 
344 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  32.82 
 
 
344 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  29.57 
 
 
376 aa  86.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  30.15 
 
 
346 aa  87  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  29.39 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  27.61 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.74 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  27.66 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  27.07 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  26.3 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  30.52 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  25.87 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  31.1 
 
 
364 aa  72.4  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  28.02 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  28.02 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  28.9 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  41.24 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  37.63 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  28.49 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  29.95 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  26.76 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.17 
 
 
365 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  28.19 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  36.26 
 
 
355 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  34.38 
 
 
343 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  31.02 
 
 
361 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  45.95 
 
 
327 aa  63.5  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1595  luciferase-like monooxygenase  39.56 
 
 
385 aa  62.8  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.823817  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  31.98 
 
 
374 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  25.84 
 
 
355 aa  62.8  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  34.38 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  28.63 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  28.73 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  32.03 
 
 
358 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  36.9 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  38.1 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  33.01 
 
 
352 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  43.04 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  33.58 
 
 
343 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  36.84 
 
 
323 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  25.65 
 
 
362 aa  60.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  36.27 
 
 
330 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20270  hypothetical protein  64.91 
 
 
58 aa  59.7  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0458549  normal  0.306219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  30.09 
 
 
357 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  42.86 
 
 
342 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  30.53 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  31.82 
 
 
386 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  29.01 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  25.3 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  30.53 
 
 
343 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  41.25 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>