More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3758 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  100 
 
 
361 aa  721    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  81.29 
 
 
344 aa  559  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  68.53 
 
 
341 aa  473  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  69.12 
 
 
345 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  67.45 
 
 
338 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  65.59 
 
 
340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  61.99 
 
 
340 aa  421  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  64.6 
 
 
340 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  61.99 
 
 
341 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  61.99 
 
 
340 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  60.7 
 
 
341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  59.94 
 
 
344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  61.11 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  58.48 
 
 
340 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  59.24 
 
 
344 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  59.94 
 
 
340 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  59.65 
 
 
340 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  59.82 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  60.82 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  59.65 
 
 
340 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  59.36 
 
 
340 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  59.36 
 
 
340 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  58.77 
 
 
340 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  58.48 
 
 
340 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  57.89 
 
 
340 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  59.94 
 
 
348 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  57.68 
 
 
354 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  50.57 
 
 
355 aa  314  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  56.06 
 
 
274 aa  263  4e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  49.03 
 
 
258 aa  207  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  33.24 
 
 
350 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  31.53 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  31.16 
 
 
372 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  35.42 
 
 
381 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  31.79 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  28.85 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  31.41 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.67 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  30.77 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  30.17 
 
 
359 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  31.95 
 
 
342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  28.57 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  30.75 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  32.85 
 
 
341 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  30.92 
 
 
345 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  29.78 
 
 
346 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  30.06 
 
 
344 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  30.06 
 
 
344 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 
344 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  32.58 
 
 
331 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  29.75 
 
 
348 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  31.25 
 
 
341 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  30.71 
 
 
347 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  30.25 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06220  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  58.54 
 
 
127 aa  97.1  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  29.57 
 
 
405 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  28.4 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.19 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  27.61 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  42.24 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  29.35 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  30.34 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  35.45 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  27.96 
 
 
358 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  35.65 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  33.18 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  34.86 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  33.63 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  37.72 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  40.45 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  28.89 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  41.05 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  42.86 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  27.8 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  43.24 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  38.38 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  33.04 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  34.48 
 
 
334 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  37.61 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  34.21 
 
 
353 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  27.31 
 
 
345 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  31.11 
 
 
374 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  29.26 
 
 
361 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  26.45 
 
 
347 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  27.27 
 
 
360 aa  63.5  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  30.11 
 
 
362 aa  62.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  30.11 
 
 
362 aa  62.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  27.57 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  29.36 
 
 
345 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  29.95 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  27.57 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  32.97 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  26.33 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  38.05 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20270  hypothetical protein  70.18 
 
 
58 aa  60.8  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0458549  normal  0.306219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  37.36 
 
 
330 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  26.42 
 
 
347 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  26.76 
 
 
346 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  37.78 
 
 
380 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.65 
 
 
345 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>