More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2323 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  100 
 
 		 338 aa  676    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  74.26 
 
 		 337 aa  487  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  71.14 
 
 		 341 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  70.97 
 
 		 341 aa  471  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  65.32 
 
 		 350 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  61.95 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  45.21 
 
 		 359 aa  278  7e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  46.13 
 
 		 372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  45.1 
 
 		 346 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  45.88 
 
 		 344 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  44.21 
 
 		 341 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  45.07 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  44.03 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  33.81 
 
 		 361 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  30.03 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  29.46 
 
 		 340 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  29.66 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  31.52 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.19 
 
 		 365 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  32.16 
 
 		 381 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  29.51 
 
 		 344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  29.78 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  27.37 
 
 		 344 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  28.41 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  30.77 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.91 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  28.86 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  28.86 
 
 		 341 aa  122  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  28.61 
 
 		 340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  28.1 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  28.32 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.29 
 
 		 354 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  28.49 
 
 		 344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  25.84 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  26.29 
 
 		 340 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  27.58 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  27.53 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  27.58 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  26.63 
 
 		 340 aa  113  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  26.72 
 
 		 341 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  28.12 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  23.93 
 
 		 340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  30.57 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  29.71 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  27.3 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  29.74 
 
 		 345 aa  94  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  28.74 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  29.02 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  30.42 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.19 
 
 		 372 aa  89.4  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  30.04 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  31.12 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  28.7 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  27.25 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  44.44 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  28.2 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  24.24 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  35.96 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.25 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  48.24 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  44.32 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  27.8 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  28.62 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  26.51 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  37.5 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  44.83 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  30.4 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  40.91 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  34.4 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  34.87 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  33.77 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  30.27 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  44.19 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  35.66 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  30.22 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  36.43 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  37.66 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  29.03 
 
 		 360 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  35.68 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  29.6 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  41.18 
 
 		 333 aa  67  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  36 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  34.29 
 
 		 734 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  41.18 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  39.62 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  30.27 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1217  luciferase family protein  29.8 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  30.27 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  40.17 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  31.84 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  29.61 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  32.56 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  29.63 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  35.23 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  28.65 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.34 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  36.31 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  28.22 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>