More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1985 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  100 
 
 		 331 aa  654    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  59.2 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  57.88 
 
 		 344 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  51.53 
 
 		 346 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  53.82 
 
 		 342 aa  305  9.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  50.76 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  48.45 
 
 		 372 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  47.66 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  44.03 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  42.81 
 
 		 341 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  43.17 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  41.69 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  43.34 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  34.6 
 
 		 381 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.73 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  33.02 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  30.61 
 
 		 361 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  31.86 
 
 		 338 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  31.5 
 
 		 340 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  30.23 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  32.54 
 
 		 341 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  32.28 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  31.14 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  29.11 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  29.77 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  29.15 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  29.36 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  30.57 
 
 		 344 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  29.65 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  31.76 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  28.82 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  29.65 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  28.86 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  29.45 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.37 
 
 		 365 aa  102  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  27.27 
 
 		 340 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  32.22 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  32.58 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  28.32 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  26.59 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  30.97 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.57 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  30.92 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  30.26 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  30.74 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  31.11 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  31.27 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  30.19 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  31.08 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  45.88 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  47.06 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  36.11 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  33.66 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  28.79 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  29.31 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  38.83 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  30.58 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  31.07 
 
 		 358 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  31.73 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  25.85 
 
 		 405 aa  65.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  29.8 
 
 		 439 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  30.77 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  29.71 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  28.89 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  26.03 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  41.46 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.52 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  36.89 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  28.06 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  35.92 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  36.27 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  38.3 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  31.11 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  37.66 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  31.61 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  28.28 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  27.86 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  28.28 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  27.86 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  28.28 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  26.73 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  40.21 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  33.66 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  27.92 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  33.01 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  27.5 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  32.41 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1595  luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.823817  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  31.25 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  33.01 
 
 		 396 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  34.38 
 
 		 413 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  33.01 
 
 		 396 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1217  luciferase family protein  34.07 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  33.01 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  30.61 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  26.15 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  25.76 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>