More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3765 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  100 
 
 
352 aa  728    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  32.62 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  31 
 
 
363 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.49 
 
 
353 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  30.51 
 
 
352 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  27.9 
 
 
380 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  28.86 
 
 
347 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  27.51 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  29.02 
 
 
347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  34.45 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  29.6 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  29.71 
 
 
374 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  29.46 
 
 
355 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  27.08 
 
 
341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  28.36 
 
 
358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  32.58 
 
 
355 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  28.81 
 
 
365 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  27.68 
 
 
345 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  27.52 
 
 
358 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  30.24 
 
 
346 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  28.1 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.03 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  27.79 
 
 
347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  30.06 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  30.06 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  28.16 
 
 
346 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  28.16 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  28.16 
 
 
346 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  28.09 
 
 
363 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  28.16 
 
 
346 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  27.3 
 
 
345 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  36.41 
 
 
330 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  28.78 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  28.19 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  26.44 
 
 
352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  25.44 
 
 
386 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  36.02 
 
 
327 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  25.65 
 
 
364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  36.16 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  26.15 
 
 
345 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  26.48 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  35.37 
 
 
343 aa  109  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  27.76 
 
 
329 aa  109  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  30.84 
 
 
340 aa  109  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  26.48 
 
 
343 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  25.25 
 
 
353 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  25 
 
 
402 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  25.66 
 
 
439 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  27.52 
 
 
354 aa  105  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  34.15 
 
 
333 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  31.63 
 
 
290 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  32.67 
 
 
329 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  27.44 
 
 
307 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  23.89 
 
 
362 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  26.67 
 
 
328 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  32.24 
 
 
372 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  25.63 
 
 
378 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  26.62 
 
 
328 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  37.24 
 
 
334 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  36.24 
 
 
334 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  27.11 
 
 
337 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  25.66 
 
 
436 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  25.66 
 
 
436 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  25.66 
 
 
436 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  28.3 
 
 
330 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  24.07 
 
 
439 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  33.99 
 
 
364 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  28.77 
 
 
387 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  29.03 
 
 
344 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  25.8 
 
 
345 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  29.75 
 
 
335 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
379 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  32.65 
 
 
342 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  35.46 
 
 
324 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  24 
 
 
371 aa  99.8  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  28.8 
 
 
334 aa  99.4  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  28.74 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  26.19 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  30.91 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  29.08 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  23.1 
 
 
377 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  28.76 
 
 
272 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  30.34 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  25.43 
 
 
328 aa  97.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  27.15 
 
 
328 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  24.55 
 
 
351 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  24.55 
 
 
351 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  26.39 
 
 
342 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  28.3 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  29.41 
 
 
360 aa  95.9  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  24.92 
 
 
351 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  25.55 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  24.92 
 
 
352 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  27.1 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  26.02 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  26.55 
 
 
330 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  34.5 
 
 
348 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  24.41 
 
 
345 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  28.88 
 
 
347 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>