More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1774 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  100 
 
 		 371 aa  769    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  48.04 
 
 		 348 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  40.28 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  39.18 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  37.22 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  29.65 
 
 		 364 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  32.38 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  31.58 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.82 
 
 		 353 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  26.74 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  29.01 
 
 		 362 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  29.23 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  26.65 
 
 		 334 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  28.03 
 
 		 372 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  26.32 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  28.36 
 
 		 334 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  28.24 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  28.24 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  28.17 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3635  alkanal monooxygenase  28.49 
 
 		 356 aa  116  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  28.48 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  26.1 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  30.99 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  29.66 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  29 
 
 		 333 aa  109  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  26.71 
 
 		 358 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  30.32 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  24.93 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  25.77 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  26.87 
 
 		 354 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  26.93 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  27.71 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0961  alkanal monooxygenase beta chain  27.3 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  24.86 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  25.14 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  28.53 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  28.17 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  26.46 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  29.44 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  25 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  24 
 
 		 352 aa  99.8  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  28.09 
 
 		 354 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  24.38 
 
 		 347 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  26.71 
 
 		 331 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  24.27 
 
 		 355 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  24.84 
 
 		 346 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  24.53 
 
 		 346 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  24.84 
 
 		 346 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  26.47 
 
 		 323 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  26.44 
 
 		 342 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  27.43 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  26.69 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  24.53 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  24.19 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  24.56 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  30.64 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  29.19 
 
 		 436 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  29.19 
 
 		 436 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  29.19 
 
 		 436 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  25.46 
 
 		 345 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  24.59 
 
 		 382 aa  93.2  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  24.79 
 
 		 402 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  24.3 
 
 		 345 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  28 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1184  flavin-dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 422 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117407  normal  0.0884697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  30.39 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3636  alkanal monooxygenase  24.32 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.372909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  25.84 
 
 		 345 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  22.67 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  25 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  28.71 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  25.14 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  25.46 
 
 		 387 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  23.78 
 
 		 347 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  26.99 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  26.7 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  28.03 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  27.35 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  24.9 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  31.47 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  30.6 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  37.31 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  25.64 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06241  alkanal monooxygenase beta chain  25.24 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  32.16 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  26.5 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2076  luciferase-like  26.68 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  26.15 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  25.75 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  26.87 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  25.85 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  25.36 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  24.13 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  24.69 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  26.35 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  26.16 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  29.05 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  40.91 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  25.44 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>