More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6239 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  100 
 
 		 402 aa  830    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  68.87 
 
 		 386 aa  561  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  32.53 
 
 		 364 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  31.05 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  33.96 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  30.92 
 
 		 380 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  32.8 
 
 		 362 aa  171  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  31.33 
 
 		 436 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  31.33 
 
 		 436 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  32.8 
 
 		 362 aa  171  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  32.41 
 
 		 377 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  31.33 
 
 		 436 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  30.49 
 
 		 387 aa  170  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  31.77 
 
 		 439 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  32.12 
 
 		 439 aa  169  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 379 aa  166  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  30.58 
 
 		 383 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  30.95 
 
 		 365 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  29.95 
 
 		 372 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  29.08 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  28.98 
 
 		 384 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  28.98 
 
 		 384 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  29.34 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  31.23 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 		 374 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  34.77 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  31.96 
 
 		 342 aa  126  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  28.98 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  35.08 
 
 		 329 aa  120  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  27.72 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  27.45 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  27.35 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  26.49 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  27.59 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  30.97 
 
 		 352 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  27.07 
 
 		 347 aa  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  29.69 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  25.29 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  27.4 
 
 		 345 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  27.25 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  27.35 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  29.03 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  26.74 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  30.12 
 
 		 361 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  27.4 
 
 		 345 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  27.48 
 
 		 346 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  25.77 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  32.51 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  26.46 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  33.47 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  28.88 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  28.49 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  27.22 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  27.22 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  28 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  26.69 
 
 		 346 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  25.47 
 
 		 353 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  36.42 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  25.48 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  29.74 
 
 		 330 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  28.81 
 
 		 355 aa  97.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  25.75 
 
 		 351 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  24.93 
 
 		 371 aa  97.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  28.93 
 
 		 356 aa  97.4  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  25.47 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  25.34 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  37.37 
 
 		 345 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  25.47 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  24.19 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  34.31 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  28.68 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  35.26 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  25.84 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  27.48 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  26.91 
 
 		 345 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  35.6 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  30.12 
 
 		 347 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  34.74 
 
 		 344 aa  93.2  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  25.61 
 
 		 351 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  25.21 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  28.76 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1883  Luciferase-like monooxygenase  29.66 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.560845  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  31.01 
 
 		 345 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  27.3 
 
 		 367 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1027  Luciferase-like monooxygenase  29.78 
 
 		 342 aa  90.5  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.02 
 
 		 347 aa  90.5  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  24.93 
 
 		 351 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  31.31 
 
 		 333 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  24.93 
 
 		 351 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  24.8 
 
 		 351 aa  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  28.22 
 
 		 348 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  27.03 
 
 		 321 aa  89.4  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  29.11 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  29.83 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4505  luciferase family protein  34.33 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  27.6 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  27.09 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  28.78 
 
 		 350 aa  88.2  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  34.34 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>