More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4505 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4505  luciferase family protein  100 
 
 		 350 aa  708    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  41.64 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3497  luciferase family oxidoreductase, group 1  43.27 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1883  Luciferase-like monooxygenase  41.94 
 
 		 342 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.560845  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1027  Luciferase-like monooxygenase  41.64 
 
 		 342 aa  248  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2044  Luciferase-like monooxygenase  42.82 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0320399  normal  0.0772623 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3246  Luciferase-like monooxygenase  41.62 
 
 		 342 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.59 
 
 		 349 aa  225  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.83 
 
 		 334 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  40.23 
 
 		 344 aa  216  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  38.51 
 
 		 345 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  39.42 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  38.58 
 
 		 339 aa  212  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  39.05 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.58 
 
 		 341 aa  209  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  35.19 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  37.94 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  38.55 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  34.81 
 
 		 333 aa  202  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  34.02 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  33.72 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  33.72 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  33.72 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  34.02 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  33.92 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  34.22 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  39.75 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  39.17 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  33.14 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  37.35 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  38.71 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  38.28 
 
 		 343 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  34.19 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  34.21 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  37.98 
 
 		 343 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  33.04 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  35.19 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  36.1 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  36.98 
 
 		 328 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  37.84 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  38.79 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  36.03 
 
 		 356 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.09 
 
 		 340 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  36.39 
 
 		 346 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  33.81 
 
 		 348 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  34.12 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  35.71 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  34.02 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  35.01 
 
 		 328 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  34.8 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  34.23 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  34.48 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  34.02 
 
 		 341 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  37.13 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  37.13 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  36.47 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  37.13 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  37.01 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  37.01 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  37.01 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  33.53 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  36.83 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.71 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  33.83 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  35.12 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1983  luciferase family protein  32.65 
 
 		 338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437489  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  34.39 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  34.63 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.31 
 
 		 357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  33.33 
 
 		 335 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  36.31 
 
 		 424 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  32.84 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  36.31 
 
 		 336 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  36.31 
 
 		 352 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  34.93 
 
 		 335 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  36.42 
 
 		 332 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  34.34 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  32.43 
 
 		 335 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  34.88 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3043  luciferase family protein  35.99 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  36.01 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  36.04 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  36.01 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  36.01 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  35.45 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3897  luciferase family protein  36.15 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  36.34 
 
 		 357 aa  169  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  33.53 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  33.03 
 
 		 351 aa  169  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  32.73 
 
 		 347 aa  169  8e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  33.03 
 
 		 351 aa  169  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3171  luciferase family protein  35.69 
 
 		 326 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  35.87 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0889  luciferase-like  34.81 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.761673  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1563  putative oxidoreductase  36.58 
 
 		 335 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  31.83 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  34.59 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1060  luciferase family protein  31.95 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2544  luciferase family protein  34.62 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0214  luciferase family protein  36.2 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.527708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>