More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2679 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
353 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  53.61 
 
 
355 aa  333  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  51.81 
 
 
356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  50.46 
 
 
340 aa  295  8e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  47.88 
 
 
351 aa  282  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  45.73 
 
 
338 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  46.36 
 
 
339 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  46.04 
 
 
338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  47.04 
 
 
341 aa  272  6e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  44.82 
 
 
338 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  46.22 
 
 
338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  44.51 
 
 
339 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  46.76 
 
 
361 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  46.48 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  46.48 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  46.18 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  46.18 
 
 
332 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  46.18 
 
 
332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  45.57 
 
 
332 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  43.08 
 
 
337 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  45.57 
 
 
332 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  45.07 
 
 
312 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  44.95 
 
 
331 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  46.34 
 
 
352 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  46.34 
 
 
336 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  46.34 
 
 
424 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  46.04 
 
 
397 aa  249  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  42.99 
 
 
338 aa  249  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  45.09 
 
 
327 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  46.04 
 
 
352 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  45.43 
 
 
335 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  45.62 
 
 
357 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  46.04 
 
 
336 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  46.04 
 
 
352 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  45.4 
 
 
327 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  42.01 
 
 
345 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  44.04 
 
 
339 aa  246  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  45.43 
 
 
332 aa  245  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  46.22 
 
 
337 aa  245  8e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  42.15 
 
 
343 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  44 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  44.92 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  44.34 
 
 
343 aa  243  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  46.04 
 
 
348 aa  242  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  44.55 
 
 
357 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  43.35 
 
 
341 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  44.65 
 
 
347 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  43.73 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  45.57 
 
 
331 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  44.34 
 
 
351 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  44.34 
 
 
351 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3336  Luciferase-like monooxygenase  45.62 
 
 
352 aa  239  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0310508  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  43.6 
 
 
331 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  41.9 
 
 
333 aa  237  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  42.81 
 
 
343 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  43.33 
 
 
328 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  42.81 
 
 
331 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  43.29 
 
 
331 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  43.29 
 
 
333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  44.57 
 
 
346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3171  luciferase family protein  45.45 
 
 
326 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977634  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  41.41 
 
 
343 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.79 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2544  luciferase family protein  44.69 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154645  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  39.64 
 
 
334 aa  233  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  43.64 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  41.28 
 
 
335 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  42.3 
 
 
334 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  40.96 
 
 
336 aa  233  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  40.98 
 
 
335 aa  232  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  41.64 
 
 
331 aa  232  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  40.98 
 
 
335 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  40.98 
 
 
335 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  40.98 
 
 
335 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  40.98 
 
 
335 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0742204 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  40.98 
 
 
335 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  40.98 
 
 
335 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1563  putative oxidoreductase  45.54 
 
 
335 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  39.21 
 
 
338 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  43.9 
 
 
333 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  40.98 
 
 
335 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0356  luciferase family protein  41.99 
 
 
339 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3973  luciferase family protein  43.52 
 
 
361 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  40.62 
 
 
333 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  42.34 
 
 
353 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  44.28 
 
 
343 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  43.6 
 
 
333 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  44.28 
 
 
343 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  43.6 
 
 
333 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  41.28 
 
 
335 aa  229  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0889  luciferase-like  42.39 
 
 
328 aa  229  8e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.761673  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2678  luciferase family protein  43.12 
 
 
326 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0310045  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  44.55 
 
 
335 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  41.69 
 
 
334 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  41.69 
 
 
334 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  40.98 
 
 
335 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0214  luciferase family protein  46.01 
 
 
327 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.527708 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  43.43 
 
 
337 aa  227  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  40.98 
 
 
335 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  40.62 
 
 
333 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>