More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0103 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  95.81 
 
 		 334 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  100 
 
 		 334 aa  684    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  96.41 
 
 		 334 aa  663    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  93.71 
 
 		 334 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  82.23 
 
 		 333 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  81.46 
 
 		 333 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  81.46 
 
 		 333 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  71.12 
 
 		 333 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  70.73 
 
 		 333 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  71.04 
 
 		 333 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  69.21 
 
 		 331 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1115  luciferase family protein  57.98 
 
 		 335 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  57.67 
 
 		 335 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1206  luciferase family protein  57.67 
 
 		 335 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3598  luciferase family protein  58.43 
 
 		 336 aa  401  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000425972  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3184  Luciferase-like monooxygenase  57.98 
 
 		 335 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0529886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  56.23 
 
 		 335 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  58.56 
 
 		 336 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  57.67 
 
 		 348 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  57.67 
 
 		 349 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  58.48 
 
 		 334 aa  391  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  57.72 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  57.01 
 
 		 333 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  58.2 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  59.57 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  59.57 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  59.15 
 
 		 424 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  59.57 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  59.57 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  59.57 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  58.64 
 
 		 397 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  57.28 
 
 		 331 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  56.02 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  57.01 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3973  luciferase family protein  57.55 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  56.7 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  58.88 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  56.17 
 
 		 337 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  57.01 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  57.63 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  57.63 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  57.63 
 
 		 332 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0356  luciferase family protein  57.5 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  55.66 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  57.63 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  56.97 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  57.54 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  56.97 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  51.37 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  55.38 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  55.49 
 
 		 339 aa  363  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  53.09 
 
 		 335 aa  363  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  56.67 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  54.63 
 
 		 343 aa  359  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  56.21 
 
 		 328 aa  358  8e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  54.46 
 
 		 331 aa  354  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  52.44 
 
 		 341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  53.54 
 
 		 327 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  53.73 
 
 		 343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  52.63 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  53.11 
 
 		 343 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  54.49 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  53.54 
 
 		 327 aa  349  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  52.92 
 
 		 335 aa  349  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  54.35 
 
 		 346 aa  348  7e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  51.08 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  53.12 
 
 		 335 aa  346  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  53.58 
 
 		 328 aa  346  4e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  50.77 
 
 		 335 aa  345  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  50.93 
 
 		 335 aa  344  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  50.93 
 
 		 335 aa  344  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  51.55 
 
 		 335 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  50.93 
 
 		 335 aa  344  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  50.93 
 
 		 335 aa  344  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  50.93 
 
 		 335 aa  343  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  50.93 
 
 		 335 aa  343  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  53.12 
 
 		 351 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  50.93 
 
 		 335 aa  343  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  53.12 
 
 		 351 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  50.93 
 
 		 335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  50.93 
 
 		 335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  52.5 
 
 		 333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  50.93 
 
 		 335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  53.99 
 
 		 331 aa  342  4e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  51.69 
 
 		 335 aa  342  4e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  53.12 
 
 		 347 aa  342  5e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  50.93 
 
 		 335 aa  342  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  50.62 
 
 		 335 aa  341  9e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  53.77 
 
 		 335 aa  341  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  53.77 
 
 		 335 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  53.73 
 
 		 348 aa  338  9e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  51.52 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  53.75 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  53.89 
 
 		 338 aa  335  7e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  52.17 
 
 		 332 aa  332  5e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  51.71 
 
 		 330 aa  331  9e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  50.61 
 
 		 338 aa  330  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  51.37 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  51.56 
 
 		 333 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  55.11 
 
 		 338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>