More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6468 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  100 
 
 
356 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  77.61 
 
 
355 aa  524  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  59.59 
 
 
340 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  59.58 
 
 
351 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  53.37 
 
 
339 aa  338  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  51.81 
 
 
353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  50.3 
 
 
328 aa  316  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  50.15 
 
 
335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  54.9 
 
 
361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  51.64 
 
 
357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  50.46 
 
 
331 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  52.91 
 
 
341 aa  311  7.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  52.31 
 
 
352 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  52.79 
 
 
336 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  49.71 
 
 
339 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  52.31 
 
 
352 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  52.03 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  52.31 
 
 
352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  50.15 
 
 
327 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  52.31 
 
 
424 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  51.52 
 
 
338 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  49.85 
 
 
327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  48.96 
 
 
334 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  52.57 
 
 
397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  48.96 
 
 
334 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  48.99 
 
 
338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  50.46 
 
 
338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  49.24 
 
 
333 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  50.9 
 
 
332 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  50.9 
 
 
332 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  49.7 
 
 
338 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  51.17 
 
 
333 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  47.77 
 
 
334 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  49.1 
 
 
339 aa  300  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  48.19 
 
 
337 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  50.89 
 
 
333 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  48.05 
 
 
341 aa  298  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  47.77 
 
 
334 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  50.76 
 
 
332 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  50.3 
 
 
332 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  50.3 
 
 
332 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  50.3 
 
 
332 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  48.34 
 
 
333 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  49.1 
 
 
336 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  50.15 
 
 
335 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  48.51 
 
 
333 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  49.7 
 
 
332 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  48.33 
 
 
343 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  50.3 
 
 
331 aa  295  8e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  48.19 
 
 
335 aa  294  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  48.63 
 
 
335 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  48.63 
 
 
335 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  52.42 
 
 
338 aa  292  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  50.76 
 
 
343 aa  292  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  48.63 
 
 
335 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  48.63 
 
 
335 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  48.33 
 
 
335 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  47.58 
 
 
331 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  50.46 
 
 
343 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  48.35 
 
 
347 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  47.88 
 
 
335 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  48.05 
 
 
351 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  48.51 
 
 
331 aa  289  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  48.05 
 
 
351 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  50.3 
 
 
357 aa  289  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  47.27 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  47.16 
 
 
333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  48.94 
 
 
335 aa  289  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  46.88 
 
 
338 aa  288  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  49.38 
 
 
335 aa  288  8e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  46.26 
 
 
331 aa  288  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.741431 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  47.72 
 
 
335 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  49.11 
 
 
340 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  47.72 
 
 
335 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  47.72 
 
 
335 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  47.72 
 
 
335 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  50.45 
 
 
341 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.019726 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  47.72 
 
 
335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  47.42 
 
 
335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  47.72 
 
 
335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  47.4 
 
 
343 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3336  Luciferase-like monooxygenase  50 
 
 
352 aa  285  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0310508  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  48.93 
 
 
339 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  47.42 
 
 
335 aa  285  8e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  51.52 
 
 
346 aa  285  9e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  46.99 
 
 
333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  45.54 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  50.46 
 
 
333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  47.27 
 
 
333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  47.09 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  45.54 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  50.92 
 
 
337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  49.39 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  49.4 
 
 
336 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  48.65 
 
 
337 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  44.94 
 
 
339 aa  281  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  47.87 
 
 
332 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  46.63 
 
 
331 aa  280  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  48.8 
 
 
333 aa  279  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  48.93 
 
 
346 aa  278  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>