More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2201 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
338 aa  663    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  65.45 
 
 
336 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  63.55 
 
 
338 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  66.06 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  63.64 
 
 
331 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  64.92 
 
 
343 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  65.76 
 
 
352 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  65.76 
 
 
424 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  65.76 
 
 
336 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  65.76 
 
 
352 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  65.76 
 
 
336 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  65.76 
 
 
352 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  62.73 
 
 
337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  64.85 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  62.24 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  64.24 
 
 
332 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  64.55 
 
 
332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  60.67 
 
 
341 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  63.75 
 
 
332 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  63.64 
 
 
332 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  63.44 
 
 
332 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  63.44 
 
 
332 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  60.06 
 
 
339 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  62.54 
 
 
332 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  60.73 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  59.64 
 
 
339 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  61.28 
 
 
343 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  60 
 
 
328 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  60.49 
 
 
331 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  60.73 
 
 
333 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  59.2 
 
 
335 aa  391  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  59.88 
 
 
327 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  60.06 
 
 
331 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  63.3 
 
 
338 aa  388  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  60.19 
 
 
327 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  59.64 
 
 
340 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  59.51 
 
 
335 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  61.32 
 
 
328 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  57.32 
 
 
347 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  57.62 
 
 
351 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  57.62 
 
 
351 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  56.71 
 
 
335 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  57.89 
 
 
333 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  63.16 
 
 
335 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  62.69 
 
 
335 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  56.1 
 
 
335 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  55.79 
 
 
335 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  55.79 
 
 
335 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  56.1 
 
 
335 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  58.33 
 
 
334 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  56.1 
 
 
335 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  56.1 
 
 
335 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  56.1 
 
 
335 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  58.46 
 
 
353 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  56.4 
 
 
335 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  56.1 
 
 
335 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  56.1 
 
 
335 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  60.37 
 
 
357 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  58.51 
 
 
333 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  55.18 
 
 
335 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  56.1 
 
 
335 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  55.18 
 
 
330 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  60.18 
 
 
333 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  56.1 
 
 
335 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  60.92 
 
 
337 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  60 
 
 
343 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  60.3 
 
 
343 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  55.79 
 
 
335 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  56.57 
 
 
338 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  54.1 
 
 
335 aa  363  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  60.99 
 
 
346 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  56.02 
 
 
332 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  56.84 
 
 
328 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  55.25 
 
 
333 aa  349  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  53.85 
 
 
339 aa  348  7e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  53.85 
 
 
339 aa  347  1e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1808  luciferase-like  52.16 
 
 
334 aa  347  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03839  flavin dependent oxidoreductase  51.23 
 
 
328 aa  344  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  53.23 
 
 
349 aa  344  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  55.69 
 
 
336 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  52.92 
 
 
347 aa  342  7e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  54.32 
 
 
333 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0927  luciferase-like  54.63 
 
 
333 aa  339  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.928282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  52.15 
 
 
335 aa  339  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  58.39 
 
 
348 aa  339  5e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  55.11 
 
 
334 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1115  luciferase family protein  52.76 
 
 
335 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1360  luciferase-like protein  55.49 
 
 
345 aa  338  7e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675179  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  56.04 
 
 
334 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  55.11 
 
 
334 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1206  luciferase family protein  52.45 
 
 
335 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  55.08 
 
 
331 aa  337  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  54.8 
 
 
334 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  55.69 
 
 
333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  53.7 
 
 
333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  52.15 
 
 
335 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0889  luciferase-like  51.86 
 
 
328 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.761673  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  52.31 
 
 
348 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  55.38 
 
 
333 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3184  Luciferase-like monooxygenase  52.45 
 
 
335 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0529886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>