More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0643 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
343 aa  676    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  97.08 
 
 
343 aa  642    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3973  luciferase family protein  83.75 
 
 
361 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  78.15 
 
 
336 aa  508  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  75.91 
 
 
333 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  76.09 
 
 
334 aa  499  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  64.06 
 
 
333 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  63.44 
 
 
333 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  63.12 
 
 
331 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  60.44 
 
 
333 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  60.44 
 
 
333 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  59.19 
 
 
333 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  59.19 
 
 
333 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  57.14 
 
 
334 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  57.45 
 
 
334 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  57.14 
 
 
334 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  56.52 
 
 
334 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0356  luciferase family protein  56.42 
 
 
339 aa  378  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  57.14 
 
 
343 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1206  luciferase family protein  55.03 
 
 
335 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  57.4 
 
 
335 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  55.97 
 
 
335 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  55.35 
 
 
335 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1115  luciferase family protein  55.03 
 
 
335 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  59.15 
 
 
336 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  58.73 
 
 
352 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  59.15 
 
 
424 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  57.88 
 
 
332 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  57.88 
 
 
332 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  56.84 
 
 
337 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  58.43 
 
 
397 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  57.88 
 
 
332 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  58.43 
 
 
352 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  58.43 
 
 
336 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  58.43 
 
 
352 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3184  Luciferase-like monooxygenase  54.4 
 
 
335 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0529886 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  56.83 
 
 
331 aa  362  8e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  57.4 
 
 
343 aa  361  9e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  57.49 
 
 
332 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  58.26 
 
 
332 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  57.4 
 
 
343 aa  360  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  56.57 
 
 
336 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  55.9 
 
 
327 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  55.28 
 
 
327 aa  359  3e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  57.19 
 
 
332 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  56.59 
 
 
335 aa  358  8e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  56.88 
 
 
331 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  56.88 
 
 
332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3598  luciferase family protein  53.25 
 
 
336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000425972  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  59.7 
 
 
333 aa  356  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  54.09 
 
 
347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  56.97 
 
 
346 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  54.09 
 
 
349 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  55.62 
 
 
338 aa  355  5e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  55.14 
 
 
331 aa  354  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  55.76 
 
 
328 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  56.88 
 
 
331 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  54.46 
 
 
335 aa  351  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  54.79 
 
 
336 aa  350  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  53.77 
 
 
348 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  54.49 
 
 
339 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  57.06 
 
 
332 aa  349  4e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  53.01 
 
 
343 aa  346  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  54.69 
 
 
351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  54.69 
 
 
351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  54.24 
 
 
339 aa  341  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  52.13 
 
 
335 aa  340  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  54.06 
 
 
347 aa  340  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  53.21 
 
 
338 aa  339  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0927  luciferase-like  55.14 
 
 
333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.928282  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  54.77 
 
 
357 aa  338  7e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2544  luciferase family protein  55.83 
 
 
326 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154645  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3171  luciferase family protein  56.13 
 
 
326 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977634  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  53.42 
 
 
331 aa  337  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2678  luciferase family protein  55.35 
 
 
326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0310045  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  52.6 
 
 
335 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  54.06 
 
 
328 aa  335  5e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  52.13 
 
 
341 aa  335  7e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  51.4 
 
 
334 aa  334  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  53.42 
 
 
331 aa  334  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  54.46 
 
 
337 aa  333  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  53.23 
 
 
353 aa  333  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  54.06 
 
 
333 aa  333  4e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  53.61 
 
 
335 aa  332  7.000000000000001e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  50.6 
 
 
335 aa  331  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  52.81 
 
 
333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  53.42 
 
 
337 aa  326  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  49.39 
 
 
335 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3043  luciferase family protein  54.15 
 
 
327 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  52.81 
 
 
333 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  49.69 
 
 
335 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1360  luciferase-like protein  52.62 
 
 
345 aa  323  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675179  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  49.08 
 
 
335 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  49.08 
 
 
335 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  49.08 
 
 
335 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  55.11 
 
 
348 aa  322  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  53.52 
 
 
338 aa  322  6e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0214  luciferase family protein  56.31 
 
 
327 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.527708 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1563  putative oxidoreductase  56.31 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0889  luciferase-like  52.19 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.761673  normal  0.656027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>