More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5936 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  100 
 
 		 343 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  90.03 
 
 		 337 aa  610  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  72.95 
 
 		 336 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  69.88 
 
 		 331 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  68.67 
 
 		 331 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  67.17 
 
 		 331 aa  451  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  68 
 
 		 328 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  69.33 
 
 		 332 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  68.83 
 
 		 332 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  69.02 
 
 		 332 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  68.83 
 
 		 332 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  69.02 
 
 		 332 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  68.83 
 
 		 332 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  66.67 
 
 		 352 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  66.67 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  68.1 
 
 		 332 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  63.94 
 
 		 338 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  66.67 
 
 		 336 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  66.67 
 
 		 352 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  66.67 
 
 		 336 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  65.44 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  66.67 
 
 		 352 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  65.24 
 
 		 327 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  67.17 
 
 		 397 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  64.2 
 
 		 333 aa  431  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  65.55 
 
 		 327 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  67.27 
 
 		 331 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  65.43 
 
 		 328 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  65.66 
 
 		 335 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  66.05 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  63.04 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  62.85 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  63.19 
 
 		 335 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  61.7 
 
 		 347 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  62.46 
 
 		 357 aa  411  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  61.82 
 
 		 328 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  62.95 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  64.24 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  63.94 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  62.01 
 
 		 351 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  62.01 
 
 		 351 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  60.23 
 
 		 340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  64.11 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  64.92 
 
 		 338 aa  401  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  61.56 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  58.31 
 
 		 335 aa  398  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  57.01 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  59.02 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  57.32 
 
 		 335 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  57.01 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  57.32 
 
 		 335 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  59.63 
 
 		 335 aa  391  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  57.49 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  57.49 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  57.49 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  59.26 
 
 		 332 aa  388  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  57.49 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  57.49 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  57.32 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  57.49 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  57.19 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  57.49 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  57.01 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  55.21 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  58.51 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  57.19 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0889  luciferase-like  57.41 
 
 		 328 aa  381  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.761673  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0927  luciferase-like  57.85 
 
 		 333 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.928282  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  55.69 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  58.51 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  57.49 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1563  putative oxidoreductase  60.12 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3043  luciferase family protein  59.39 
 
 		 327 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  62.04 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0214  luciferase family protein  60 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.527708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  55.38 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  57.5 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  56 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  57.19 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  57.58 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  54.8 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  55.31 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  59.38 
 
 		 343 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  56.79 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  55.31 
 
 		 335 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1115  luciferase family protein  55 
 
 		 335 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1206  luciferase family protein  55 
 
 		 335 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  53.55 
 
 		 343 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  55.08 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  55.25 
 
 		 334 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  57.49 
 
 		 336 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  57.5 
 
 		 337 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3184  Luciferase-like monooxygenase  54.69 
 
 		 335 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0529886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  53.07 
 
 		 335 aa  361  8e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  58.82 
 
 		 331 aa  361  9e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3973  luciferase family protein  59.12 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3598  luciferase family protein  55.69 
 
 		 336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000425972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  54.37 
 
 		 348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1983  luciferase family protein  52.29 
 
 		 338 aa  355  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437489  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  58.13 
 
 		 337 aa  355  5e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>