More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0592 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  682    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  94.93 
 
 		 335 aa  656    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  85.53 
 
 		 339 aa  564  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  80.06 
 
 		 347 aa  548  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  79.45 
 
 		 351 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  79.45 
 
 		 351 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  78.15 
 
 		 341 aa  537  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  70.61 
 
 		 335 aa  495  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  70.61 
 
 		 335 aa  495  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  72.39 
 
 		 339 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  70.61 
 
 		 335 aa  495  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  71.78 
 
 		 335 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  70.61 
 
 		 335 aa  495  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  70.3 
 
 		 335 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  70.3 
 
 		 335 aa  492  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  70.3 
 
 		 335 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  71.17 
 
 		 335 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  70.3 
 
 		 335 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  70.86 
 
 		 335 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  70.86 
 
 		 335 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  71.47 
 
 		 335 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  70.55 
 
 		 335 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  69.02 
 
 		 335 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  65.34 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  63.8 
 
 		 331 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  64.53 
 
 		 397 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  63.5 
 
 		 336 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  64.11 
 
 		 332 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  64.22 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  64.22 
 
 		 352 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  62.88 
 
 		 332 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  63.5 
 
 		 332 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  63.8 
 
 		 332 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  63.5 
 
 		 332 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  60.43 
 
 		 335 aa  411  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  63.5 
 
 		 332 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  63.8 
 
 		 332 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  64.22 
 
 		 352 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  64.22 
 
 		 336 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  64.22 
 
 		 352 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  64.22 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  62.58 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  61.01 
 
 		 337 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  62.65 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  62.58 
 
 		 335 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  59.87 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  57.4 
 
 		 353 aa  393  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  59.63 
 
 		 343 aa  391  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  60.37 
 
 		 328 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  59.94 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  60.99 
 
 		 333 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  59.2 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  61.01 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  56.25 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  59.43 
 
 		 357 aa  381  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  60.69 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  61.32 
 
 		 346 aa  381  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  58.59 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  58.57 
 
 		 327 aa  381  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  58.26 
 
 		 327 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  59.51 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  57.41 
 
 		 328 aa  378  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  56.44 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  56.29 
 
 		 333 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  57.23 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  59.51 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0889  luciferase-like  56.21 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.761673  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  54.66 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  56.44 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  56.8 
 
 		 340 aa  363  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  56.83 
 
 		 331 aa  359  5e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  55.25 
 
 		 333 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  54.52 
 
 		 336 aa  354  8.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  51.23 
 
 		 330 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  55.35 
 
 		 343 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3043  luciferase family protein  54.91 
 
 		 327 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03839  flavin dependent oxidoreductase  50 
 
 		 328 aa  348  9e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1563  putative oxidoreductase  56.13 
 
 		 335 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0214  luciferase family protein  55.83 
 
 		 327 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.527708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  54.63 
 
 		 333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  53.77 
 
 		 334 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  57.8 
 
 		 348 aa  340  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1776  luciferase family protein  52.96 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  53.14 
 
 		 334 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  51.36 
 
 		 338 aa  339  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1808  luciferase-like  51.57 
 
 		 334 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  50.46 
 
 		 339 aa  338  7e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1983  luciferase family protein  48.92 
 
 		 338 aa  338  8e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437489  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  50.3 
 
 		 339 aa  338  9e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  54.86 
 
 		 336 aa  338  9e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  53.42 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  53.14 
 
 		 334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  52.15 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  55.42 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  52 
 
 		 334 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  52.32 
 
 		 333 aa  335  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  52.32 
 
 		 333 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  53.11 
 
 		 333 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  54.86 
 
 		 334 aa  332  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  50.15 
 
 		 349 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>