More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3539 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  93.79 
 
 		 338 aa  648    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  100 
 
 		 338 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  91.72 
 
 		 338 aa  627  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  83.38 
 
 		 339 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  79.74 
 
 		 312 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  61.26 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  55.79 
 
 		 339 aa  352  7e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  51.67 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  51.52 
 
 		 356 aa  308  6.999999999999999e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  48.96 
 
 		 351 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  50.45 
 
 		 346 aa  294  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  47.46 
 
 		 340 aa  289  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  47.45 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  48.67 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  49.24 
 
 		 397 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  49.24 
 
 		 352 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  49.24 
 
 		 336 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  49.24 
 
 		 352 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  45.19 
 
 		 345 aa  275  9e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  46.04 
 
 		 353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  49.24 
 
 		 352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  47.55 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  49.24 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  49.24 
 
 		 424 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  48.79 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  46.04 
 
 		 339 aa  272  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  45.09 
 
 		 331 aa  272  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  44.82 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  43.5 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  46.65 
 
 		 357 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  45.76 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  47.4 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  45.76 
 
 		 349 aa  268  8e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  44.74 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  45.45 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  43.5 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  46.39 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  44.61 
 
 		 338 aa  266  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  45.81 
 
 		 331 aa  265  5.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  42.69 
 
 		 335 aa  265  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  46.01 
 
 		 337 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  43.6 
 
 		 348 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  44.68 
 
 		 350 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  45.73 
 
 		 332 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  45.51 
 
 		 343 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  42.34 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  45.59 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  43.07 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  45.73 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  43.81 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  46.22 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  45.26 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  42.04 
 
 		 333 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  42.04 
 
 		 333 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  43.29 
 
 		 348 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  42.04 
 
 		 333 aa  262  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  42.17 
 
 		 333 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  44.84 
 
 		 331 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  43.71 
 
 		 334 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  44.85 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  45.15 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  47.59 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  45.92 
 
 		 332 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  45.92 
 
 		 332 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  45.92 
 
 		 332 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  41.87 
 
 		 333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  46.22 
 
 		 332 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  42.9 
 
 		 339 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  41.44 
 
 		 333 aa  259  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  41.14 
 
 		 333 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  43.92 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  43.07 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  45.78 
 
 		 333 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  43.64 
 
 		 337 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  40.54 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  44.05 
 
 		 340 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  43.47 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  43.29 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  44.71 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  44.38 
 
 		 333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  43.07 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  43.36 
 
 		 353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  44.65 
 
 		 347 aa  252  6e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  45.43 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  40.83 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  44.34 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  40.48 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  44.34 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  45.12 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  43.24 
 
 		 355 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  44.31 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  43.71 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  41.12 
 
 		 339 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  44.04 
 
 		 336 aa  248  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  43.75 
 
 		 334 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  42.65 
 
 		 334 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  42.07 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  42.07 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  42.07 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  43.41 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>