More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7059 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  100 
 
 
312 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  79.74 
 
 
338 aa  510  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  79.42 
 
 
338 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  79.74 
 
 
338 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  79.81 
 
 
339 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  63.96 
 
 
341 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  56.31 
 
 
339 aa  338  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  50.48 
 
 
355 aa  290  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  51.14 
 
 
346 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  49.67 
 
 
356 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  48.72 
 
 
351 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  47.12 
 
 
340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  46.58 
 
 
357 aa  261  8e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  48.73 
 
 
361 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  46.25 
 
 
343 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  44.44 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  43.91 
 
 
348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  45.6 
 
 
343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  43.91 
 
 
350 aa  252  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  49.83 
 
 
397 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  45.03 
 
 
339 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  45.57 
 
 
357 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  45.07 
 
 
353 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  46.3 
 
 
338 aa  248  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  43.49 
 
 
345 aa  248  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  46.53 
 
 
341 aa  248  7e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  48.84 
 
 
352 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  44.95 
 
 
346 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  49.01 
 
 
336 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  44.59 
 
 
341 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  48.84 
 
 
352 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  48.84 
 
 
352 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  49.01 
 
 
336 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  48.84 
 
 
424 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  42.44 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  44.04 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  42.44 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  45.69 
 
 
337 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  43 
 
 
341 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  43.04 
 
 
335 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  47.9 
 
 
337 aa  242  6e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  44.08 
 
 
331 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  46.69 
 
 
332 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  46.84 
 
 
332 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  46.69 
 
 
332 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  46.69 
 
 
332 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  46.05 
 
 
331 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  46.84 
 
 
332 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  45.57 
 
 
335 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  44.37 
 
 
335 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  43.38 
 
 
335 aa  239  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  46.51 
 
 
332 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  44.26 
 
 
353 aa  238  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  43.61 
 
 
328 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  43.75 
 
 
333 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  44.19 
 
 
349 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  45.51 
 
 
332 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  46.2 
 
 
333 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  42.76 
 
 
338 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  43.51 
 
 
334 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  44.41 
 
 
343 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  43.51 
 
 
334 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  45.57 
 
 
343 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  44.81 
 
 
335 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  41.37 
 
 
341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  45.25 
 
 
343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  42.43 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  43.18 
 
 
334 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  44.59 
 
 
333 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  43.42 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  41.5 
 
 
339 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  44.22 
 
 
337 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  41.97 
 
 
331 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  42.16 
 
 
355 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  44.34 
 
 
328 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  43.65 
 
 
333 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  45.48 
 
 
334 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  42.35 
 
 
334 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  42.86 
 
 
347 aa  228  7e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  43.32 
 
 
333 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  42.52 
 
 
351 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  42.52 
 
 
351 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  41.58 
 
 
335 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  46.03 
 
 
338 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  41.58 
 
 
335 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  41.58 
 
 
335 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  41.58 
 
 
335 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  40.79 
 
 
327 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  42.01 
 
 
333 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  43.05 
 
 
332 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  41.58 
 
 
335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.13 
 
 
334 aa  225  9e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  42.86 
 
 
340 aa  224  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  40.92 
 
 
335 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  40.92 
 
 
335 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  40.79 
 
 
327 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  40.92 
 
 
335 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  39.74 
 
 
333 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2544  luciferase family protein  42.76 
 
 
326 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154645  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  40.92 
 
 
335 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>