More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2462 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  711    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  90.7 
 
 		 348 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  90.61 
 
 		 348 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  74.85 
 
 		 339 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  71.39 
 
 		 341 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  72.56 
 
 		 334 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  71.6 
 
 		 339 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  71.13 
 
 		 339 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  45.51 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  43.41 
 
 		 341 aa  275  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  45.02 
 
 		 338 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  40.96 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  44.68 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  40.96 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  44.07 
 
 		 338 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  40.66 
 
 		 333 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  40.06 
 
 		 333 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  40.06 
 
 		 333 aa  262  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  40.06 
 
 		 333 aa  262  8e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  40.06 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  40.06 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  43.75 
 
 		 339 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  40.06 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  40.06 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  43.91 
 
 		 312 aa  252  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.25 
 
 		 334 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  44.01 
 
 		 355 aa  249  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  41.34 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  43.75 
 
 		 349 aa  242  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.53 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  41.41 
 
 		 355 aa  229  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  40.61 
 
 		 357 aa  228  8e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  40.99 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  40.82 
 
 		 341 aa  225  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  40.42 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  41.06 
 
 		 344 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2190  luciferase-like monooxygenase  41.88 
 
 		 347 aa  223  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  43.49 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3480  luciferase family protein  42.49 
 
 		 346 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  0.078624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.91 
 
 		 340 aa  219  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1091  Luciferase-like monooxygenase  37.39 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  39.94 
 
 		 351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  40 
 
 		 357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  42.15 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  39.7 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  40.18 
 
 		 353 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2877  luciferase-like monooxygenase family protein  35.42 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819855  decreased coverage  0.0000897888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.48 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  42.18 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  37 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  37.65 
 
 		 341 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.5 
 
 		 342 aa  208  9e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  37.8 
 
 		 347 aa  206  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  38.55 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  38.18 
 
 		 335 aa  206  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  38.94 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6408  luciferase-like monooxygenase  41.57 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  38.34 
 
 		 328 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  40.24 
 
 		 352 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  40.3 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  40.24 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  37.12 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  40.24 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  37.2 
 
 		 351 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  37.2 
 
 		 351 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  38.55 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3897  luciferase family protein  40.84 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  37.72 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  39.94 
 
 		 352 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  38.04 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  39.94 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4458  luciferase family protein  39.43 
 
 		 350 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  39.94 
 
 		 352 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  38.19 
 
 		 361 aa  202  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  39.63 
 
 		 343 aa  202  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  39.63 
 
 		 397 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  38.48 
 
 		 335 aa  202  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  40.65 
 
 		 348 aa  202  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  39.33 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0889  luciferase-like  38.23 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.761673  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.21 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  36.42 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  37.42 
 
 		 331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  38.34 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  37.94 
 
 		 337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0382  luciferase family protein  35.22 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0372  luciferase family protein  35.22 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  37.31 
 
 		 327 aa  199  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  39.94 
 
 		 346 aa  198  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  36.14 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  37.61 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  38.6 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  38.3 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  38.04 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  35.69 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  38.04 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0562  luciferase-like monooxygenase  39.14 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0739  luciferase-like monooxygenase superfamily protein  39.14 
 
 		 375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1682  luciferase-like monooxygenase  39.14 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1890  luciferase-like monooxygenase  39.14 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>