More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3480 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3480  luciferase family protein  100 
 
 
346 aa  676    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  0.078624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  51.06 
 
 
340 aa  298  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  49.86 
 
 
356 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  51.21 
 
 
351 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  44.65 
 
 
327 aa  278  7e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  45.82 
 
 
338 aa  278  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  45.79 
 
 
331 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  44.95 
 
 
327 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  48.63 
 
 
355 aa  275  8e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  47.27 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  45.67 
 
 
333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  49.23 
 
 
332 aa  271  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  45.66 
 
 
337 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  47.53 
 
 
357 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  45.76 
 
 
338 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  43.77 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  45.72 
 
 
343 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  45.21 
 
 
334 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  48.47 
 
 
352 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  48.47 
 
 
336 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  48.46 
 
 
336 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  48.47 
 
 
352 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  48.47 
 
 
352 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  48.46 
 
 
336 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  48.47 
 
 
424 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  48.15 
 
 
332 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  48.15 
 
 
332 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  43.77 
 
 
333 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  48.61 
 
 
332 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  46.11 
 
 
335 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  48.61 
 
 
332 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  48.61 
 
 
332 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  48.47 
 
 
343 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  48.61 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  47.22 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  47.85 
 
 
397 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  46.53 
 
 
333 aa  266  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  43.58 
 
 
334 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  43.79 
 
 
334 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  43.88 
 
 
334 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  45.21 
 
 
335 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  48.16 
 
 
343 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  42.46 
 
 
343 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  45.99 
 
 
335 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  50 
 
 
361 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  47.72 
 
 
333 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  47.42 
 
 
333 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  48.21 
 
 
348 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  44.48 
 
 
339 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  45.02 
 
 
338 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  44.54 
 
 
353 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  45.99 
 
 
331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  46.5 
 
 
331 aa  259  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  46.87 
 
 
333 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  44.71 
 
 
338 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  44.92 
 
 
328 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  44.27 
 
 
328 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3973  luciferase family protein  48.33 
 
 
361 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  44.67 
 
 
343 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  43.43 
 
 
334 aa  256  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  44.67 
 
 
343 aa  256  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  44.71 
 
 
335 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  45.87 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  45.29 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  47.31 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  45.37 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  45.37 
 
 
333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  46.2 
 
 
353 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  43.24 
 
 
331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  44.14 
 
 
341 aa  252  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  46.83 
 
 
340 aa  251  9.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  45.26 
 
 
339 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  45.68 
 
 
346 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  45.45 
 
 
339 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1187  luciferase family protein  41.96 
 
 
331 aa  249  6e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  44 
 
 
336 aa  248  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1808  luciferase-like  41.9 
 
 
334 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  43.3 
 
 
335 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  42.99 
 
 
335 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  43.16 
 
 
338 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  46.36 
 
 
341 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  43.6 
 
 
347 aa  246  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  42.99 
 
 
335 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  42.99 
 
 
335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  43.87 
 
 
339 aa  245  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  42.99 
 
 
335 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  43.29 
 
 
351 aa  245  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  43.29 
 
 
351 aa  245  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0927  luciferase-like  46.3 
 
 
333 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.928282  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  43.21 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1563  putative oxidoreductase  47.15 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  43.38 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  42.68 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  44.06 
 
 
337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  45.24 
 
 
334 aa  243  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  42.5 
 
 
335 aa  243  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0356  luciferase family protein  42.18 
 
 
339 aa  242  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  42.63 
 
 
335 aa  242  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  42.63 
 
 
335 aa  242  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  42.63 
 
 
335 aa  242  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>