More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0571 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  100 
 
 
334 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  85.33 
 
 
339 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  85.03 
 
 
339 aa  584  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  74.77 
 
 
339 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  73.48 
 
 
348 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  72.42 
 
 
341 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  73.17 
 
 
348 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  72.56 
 
 
350 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  41.94 
 
 
345 aa  264  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  39.34 
 
 
333 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  39.34 
 
 
333 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  39.34 
 
 
333 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  39.64 
 
 
333 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  39.04 
 
 
333 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  39.34 
 
 
333 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  39.64 
 
 
333 aa  258  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  39.04 
 
 
333 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  39.1 
 
 
333 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  40.73 
 
 
341 aa  256  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  38.44 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  40.79 
 
 
339 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  40.9 
 
 
338 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.84 
 
 
334 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  40.96 
 
 
338 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  41.62 
 
 
349 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  39.76 
 
 
338 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  40.96 
 
 
355 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  40 
 
 
339 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  40.91 
 
 
357 aa  230  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  38.53 
 
 
356 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  38.72 
 
 
328 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  39.16 
 
 
312 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  39.51 
 
 
328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  39.35 
 
 
341 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  39.02 
 
 
340 aa  218  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1091  Luciferase-like monooxygenase  36.78 
 
 
337 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  38.6 
 
 
335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  38.53 
 
 
355 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4458  luciferase family protein  40 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520717  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  37.13 
 
 
351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2190  luciferase-like monooxygenase  40.06 
 
 
347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.11 
 
 
340 aa  212  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  37.99 
 
 
333 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  36.67 
 
 
338 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  35.82 
 
 
343 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  36.53 
 
 
333 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  38.86 
 
 
335 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 
353 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  36.86 
 
 
327 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2877  luciferase-like monooxygenase family protein  36.47 
 
 
337 aa  206  7e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819855  decreased coverage  0.0000897888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  39.88 
 
 
335 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  37.42 
 
 
331 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  36.86 
 
 
331 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.46 
 
 
338 aa  202  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.73 
 
 
342 aa  202  7e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  37.43 
 
 
349 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1808  luciferase-like  37.91 
 
 
334 aa  202  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  36.64 
 
 
330 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  37.43 
 
 
349 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  36.86 
 
 
327 aa  202  9e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  38.14 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  36.98 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.45 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  37.43 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.39 
 
 
341 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  40.06 
 
 
333 aa  199  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  38.14 
 
 
339 aa  199  7.999999999999999e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  37.23 
 
 
347 aa  198  9e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  37.23 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  35.4 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.54 
 
 
357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  37.23 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  39.51 
 
 
348 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  34.78 
 
 
335 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.67 
 
 
337 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  34.78 
 
 
335 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  34.78 
 
 
335 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  34.67 
 
 
335 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1360  luciferase-like protein  40.18 
 
 
345 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675179  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3480  luciferase family protein  40.37 
 
 
346 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  0.078624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  38.41 
 
 
338 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  34.78 
 
 
335 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6408  luciferase-like monooxygenase  40.18 
 
 
329 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0110823 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  34.78 
 
 
335 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0210  luciferase-like  39.82 
 
 
330 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  34.78 
 
 
335 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  38.53 
 
 
343 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3681  Luciferase-like monooxygenase  38.76 
 
 
330 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  38.23 
 
 
343 aa  193  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  35.69 
 
 
331 aa  193  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  38.76 
 
 
346 aa  193  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  39.09 
 
 
335 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  35.05 
 
 
343 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  38.6 
 
 
329 aa  192  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  35.98 
 
 
334 aa  192  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  34.14 
 
 
333 aa  192  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3897  luciferase family protein  38.17 
 
 
329 aa  192  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  35.38 
 
 
341 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  35.08 
 
 
339 aa  192  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  34.47 
 
 
335 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>