More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1436 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  100 
 
 
357 aa  696    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  52.38 
 
 
339 aa  342  5e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  50.58 
 
 
351 aa  299  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  47.09 
 
 
338 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  47.38 
 
 
338 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  49.57 
 
 
356 aa  292  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  47.09 
 
 
338 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  49.42 
 
 
355 aa  287  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  49.43 
 
 
341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  46.51 
 
 
339 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  50.74 
 
 
346 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  47.02 
 
 
312 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  46.59 
 
 
340 aa  266  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  43.79 
 
 
334 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  41.91 
 
 
345 aa  257  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  41.57 
 
 
341 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  47.37 
 
 
361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  40.52 
 
 
333 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  40.23 
 
 
333 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  40.23 
 
 
333 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  40.23 
 
 
333 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  43.15 
 
 
327 aa  251  9.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  40.23 
 
 
333 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  40.52 
 
 
333 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  40.23 
 
 
333 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  39.94 
 
 
333 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  39.65 
 
 
333 aa  250  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  45.35 
 
 
353 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  39.94 
 
 
333 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  43.03 
 
 
331 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  42.86 
 
 
327 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  44.94 
 
 
357 aa  246  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  42.11 
 
 
328 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  43.03 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  44.71 
 
 
331 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  45.67 
 
 
333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  40.94 
 
 
350 aa  236  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  45.16 
 
 
337 aa  235  8e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  41.11 
 
 
348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  40.34 
 
 
348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  44.05 
 
 
332 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  42.81 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  42.73 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  40.84 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  42.52 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  42.23 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  42.81 
 
 
332 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  41.07 
 
 
334 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  43.45 
 
 
332 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  43.45 
 
 
332 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  43.45 
 
 
332 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  42.18 
 
 
333 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  43.15 
 
 
332 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  42.49 
 
 
343 aa  232  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  42.39 
 
 
333 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.51 
 
 
338 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  41.92 
 
 
339 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  41.76 
 
 
334 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  42.73 
 
 
331 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  40.29 
 
 
335 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  41.92 
 
 
338 aa  230  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  41.79 
 
 
331 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  42.14 
 
 
334 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  41.32 
 
 
339 aa  230  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  42.14 
 
 
334 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  43.2 
 
 
338 aa  229  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  42.39 
 
 
333 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3480  luciferase family protein  48.24 
 
 
346 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  0.078624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  42.14 
 
 
334 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  43.62 
 
 
336 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  43.62 
 
 
352 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  41.52 
 
 
337 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  39.47 
 
 
339 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  43.62 
 
 
352 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  43.62 
 
 
336 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  43.62 
 
 
352 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  40.41 
 
 
341 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  43.62 
 
 
424 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  39.17 
 
 
339 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  38.99 
 
 
335 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2678  luciferase family protein  41.62 
 
 
326 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0310045  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  38.99 
 
 
335 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  38.99 
 
 
335 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  41.47 
 
 
341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  40.83 
 
 
347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  42.39 
 
 
336 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  43.32 
 
 
397 aa  225  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  40.53 
 
 
351 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  40.53 
 
 
351 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  38.99 
 
 
335 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  41.35 
 
 
334 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  42.56 
 
 
335 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3171  luciferase family protein  41.62 
 
 
326 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977634  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  38.69 
 
 
335 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  38.28 
 
 
335 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  38.39 
 
 
335 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  40.4 
 
 
344 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2877  luciferase-like monooxygenase family protein  35.65 
 
 
337 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819855  decreased coverage  0.0000897888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  42.65 
 
 
343 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2544  luciferase family protein  41.62 
 
 
326 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>