More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2156 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  100 
 
 		 344 aa  689    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  53.13 
 
 		 349 aa  331  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  46.51 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  45.03 
 
 		 345 aa  255  8e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  38.17 
 
 		 333 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.9 
 
 		 334 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  38.76 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  37.87 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  38.17 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  37.87 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  37.87 
 
 		 333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  38.17 
 
 		 333 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  42.31 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  42.9 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  38.99 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  38.17 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  37.28 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  41.39 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  41.54 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  41.54 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  41.74 
 
 		 339 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  43.11 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  42.6 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  41.06 
 
 		 350 aa  225  9e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  39.59 
 
 		 351 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  44.04 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  43.16 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  44.15 
 
 		 356 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  42.7 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  42.56 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  41.96 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  42.64 
 
 		 327 aa  219  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  41.79 
 
 		 331 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  41.9 
 
 		 312 aa  219  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  39.41 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  43.47 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  38.1 
 
 		 339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  40.23 
 
 		 357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1883  Luciferase-like monooxygenase  39.59 
 
 		 342 aa  216  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.560845  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  42.22 
 
 		 357 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4505  luciferase family protein  40.23 
 
 		 350 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  40.11 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  43.02 
 
 		 341 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  42.34 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  38.1 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  40.18 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  41.69 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  42.14 
 
 		 335 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  42.2 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  40.47 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  40.71 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  40 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  42.02 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  40.41 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  41.12 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  40.95 
 
 		 338 aa  209  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.18 
 
 		 341 aa  208  9e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  42.06 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0513  luciferase family protein  37.27 
 
 		 333 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  41.99 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  40.24 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  38.73 
 
 		 341 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  42.06 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.33 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  42.25 
 
 		 338 aa  205  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  40.42 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  40.24 
 
 		 328 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  41.49 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  40.42 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  40.42 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  40.42 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  41.25 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  41.25 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  41.25 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  41.12 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2190  luciferase-like monooxygenase  38.82 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  40.42 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  41.49 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  40.42 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  40.12 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  40.59 
 
 		 361 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  39.53 
 
 		 333 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2044  Luciferase-like monooxygenase  38.82 
 
 		 354 aa  202  6e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0320399  normal  0.0772623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  41.59 
 
 		 332 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  40.06 
 
 		 347 aa  202  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  42.22 
 
 		 346 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  40.36 
 
 		 351 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  40.12 
 
 		 335 aa  202  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  40.36 
 
 		 351 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  40.98 
 
 		 332 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  40.98 
 
 		 332 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  40.95 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  36.98 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  42.47 
 
 		 346 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  40.43 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  40.65 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1027  Luciferase-like monooxygenase  38.53 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  40.98 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10108  lkanal monooxygenase-like protein YvbT  38.11 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.842065  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  39.82 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>