More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10108 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10108  lkanal monooxygenase-like protein YvbT  100 
 
 
342 aa  708    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.842065  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0513  luciferase family protein  66.06 
 
 
333 aa  472  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  55.32 
 
 
334 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1983  luciferase family protein  50.76 
 
 
338 aa  348  8e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437489  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  48.18 
 
 
331 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  47.59 
 
 
331 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  46.34 
 
 
336 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  48.32 
 
 
335 aa  316  5e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  45.67 
 
 
351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  45.67 
 
 
351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1187  luciferase family protein  47.99 
 
 
331 aa  313  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  44.98 
 
 
339 aa  311  7.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  45.43 
 
 
332 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  47.84 
 
 
328 aa  311  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  46.04 
 
 
332 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  46.57 
 
 
338 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  45.43 
 
 
332 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  45.57 
 
 
332 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  45.59 
 
 
343 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  45.07 
 
 
347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  45.43 
 
 
332 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  45.43 
 
 
332 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  45.27 
 
 
353 aa  309  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  45.43 
 
 
332 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  46.65 
 
 
338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  45.29 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  45.48 
 
 
335 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  43.94 
 
 
336 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  43.94 
 
 
424 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  45.48 
 
 
335 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  45.48 
 
 
335 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  43.94 
 
 
336 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  43.94 
 
 
352 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  43.94 
 
 
352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  43.94 
 
 
397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  43.94 
 
 
352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1681  luciferase family protein  45.45 
 
 
337 aa  305  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1714  luciferase family protein  45.45 
 
 
337 aa  305  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00235506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  45.48 
 
 
335 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  47.81 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  45.18 
 
 
335 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  45.78 
 
 
335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  45.18 
 
 
335 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  44.68 
 
 
341 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  45.43 
 
 
339 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  44.88 
 
 
335 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  44.88 
 
 
335 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  44.88 
 
 
335 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  44.88 
 
 
335 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  44.88 
 
 
335 aa  300  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  48.77 
 
 
343 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3973  luciferase family protein  47 
 
 
361 aa  299  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  44.18 
 
 
335 aa  297  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  43.07 
 
 
335 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  44.11 
 
 
333 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  44.58 
 
 
335 aa  296  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  45.43 
 
 
331 aa  295  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  44.58 
 
 
335 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  44.58 
 
 
335 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  45.62 
 
 
343 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  45.03 
 
 
327 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0927  luciferase-like  48.6 
 
 
333 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.928282  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  46.63 
 
 
333 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1115  luciferase family protein  43.24 
 
 
335 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  45.15 
 
 
338 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  44.14 
 
 
349 aa  293  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  45.12 
 
 
331 aa  292  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3184  Luciferase-like monooxygenase  43.21 
 
 
335 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0529886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1206  luciferase family protein  42.94 
 
 
335 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  42.94 
 
 
335 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  44.86 
 
 
333 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  45.2 
 
 
334 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  43.52 
 
 
348 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  45.32 
 
 
336 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3681  Luciferase-like monooxygenase  47.88 
 
 
330 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  42.94 
 
 
335 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  45.65 
 
 
333 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  45.03 
 
 
327 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  46.25 
 
 
330 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03839  flavin dependent oxidoreductase  45.54 
 
 
328 aa  289  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3598  luciferase family protein  44.17 
 
 
336 aa  288  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000425972  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  43.52 
 
 
347 aa  288  8e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  44.38 
 
 
343 aa  288  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  46.06 
 
 
338 aa  288  9e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3897  luciferase family protein  48.16 
 
 
329 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0356  luciferase family protein  46.42 
 
 
339 aa  287  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  44.31 
 
 
343 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  44.24 
 
 
333 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  44.65 
 
 
332 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  44.31 
 
 
343 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  47.08 
 
 
357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  43.64 
 
 
333 aa  286  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  44.34 
 
 
333 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  43.2 
 
 
337 aa  285  5e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  42.55 
 
 
335 aa  285  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  45.06 
 
 
333 aa  285  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  43.83 
 
 
337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  44 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  44.58 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  45.51 
 
 
335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>