More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1187 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1187  luciferase family protein  100 
 
 		 331 aa  684    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1681  luciferase family protein  77.68 
 
 		 337 aa  554  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1714  luciferase family protein  77.68 
 
 		 337 aa  554  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00235506  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0513  luciferase family protein  47.88 
 
 		 333 aa  334  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  46.97 
 
 		 334 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  49.06 
 
 		 335 aa  316  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  45.92 
 
 		 334 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  45.02 
 
 		 334 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  45.62 
 
 		 334 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10108  lkanal monooxygenase-like protein YvbT  47.99 
 
 		 342 aa  313  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.842065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  45.62 
 
 		 333 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1983  luciferase family protein  46.69 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437489  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3184  Luciferase-like monooxygenase  47.17 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0529886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  47.8 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1115  luciferase family protein  47.17 
 
 		 335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1206  luciferase family protein  47.17 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  45.54 
 
 		 333 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  45.02 
 
 		 334 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  46.86 
 
 		 335 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  46.32 
 
 		 331 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  47.8 
 
 		 347 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  44.72 
 
 		 333 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  45.94 
 
 		 333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  46.42 
 
 		 333 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  45.09 
 
 		 327 aa  301  7.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  45.34 
 
 		 333 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  46.86 
 
 		 348 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  45.65 
 
 		 331 aa  301  8.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  46.75 
 
 		 343 aa  301  9e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  46.58 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  46.42 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  47.04 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  48.75 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  45.71 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  45.65 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  46.25 
 
 		 357 aa  298  6e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  45.31 
 
 		 341 aa  298  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3973  luciferase family protein  47.78 
 
 		 361 aa  298  7e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  45.59 
 
 		 334 aa  298  8e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  46.13 
 
 		 343 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0466  putative soluble lytic murein transglycosylase  43.93 
 
 		 346 aa  298  1e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.356874  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  45.09 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  45.62 
 
 		 331 aa  296  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  43.9 
 
 		 335 aa  296  5e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  45.77 
 
 		 331 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  44.55 
 
 		 335 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  44.06 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  45.94 
 
 		 352 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  45.94 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3598  luciferase family protein  44.48 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000425972  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  45.94 
 
 		 352 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  45.94 
 
 		 352 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  45.94 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  45.77 
 
 		 331 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  45.03 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  45.94 
 
 		 336 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  45.94 
 
 		 336 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  43.75 
 
 		 339 aa  292  5e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  43.93 
 
 		 335 aa  292  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  46.71 
 
 		 335 aa  292  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  45.11 
 
 		 343 aa  292  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  43.93 
 
 		 335 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  43.93 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  43.93 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  44.55 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  45.82 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  43.61 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  43.61 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  43.93 
 
 		 335 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  43.61 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  44.86 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  43.61 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  45.74 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  45.48 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  44.31 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  44.86 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  43.61 
 
 		 335 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  44.79 
 
 		 338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  45.48 
 
 		 332 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  45.48 
 
 		 332 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  43.3 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  43.53 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  45.48 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  43.12 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  46.08 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0643  Luciferase-like monooxygenase  45.57 
 
 		 343 aa  286  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  43.93 
 
 		 335 aa  285  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03839  flavin dependent oxidoreductase  44.69 
 
 		 328 aa  285  7e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  46.54 
 
 		 338 aa  285  7e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123209 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  43.3 
 
 		 335 aa  285  8e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1808  luciferase-like  44.24 
 
 		 334 aa  285  8e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  43.3 
 
 		 335 aa  285  8e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  45.34 
 
 		 339 aa  285  9e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0927  luciferase-like  45.91 
 
 		 333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.928282  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  45.89 
 
 		 332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  43.53 
 
 		 335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  45 
 
 		 339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  44.83 
 
 		 331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  45.45 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  45.45 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>