More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2748 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  100 
 
 
341 aa  695    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  84.27 
 
 
339 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  71.39 
 
 
348 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  72.42 
 
 
334 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  71.39 
 
 
350 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  71.52 
 
 
348 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  71 
 
 
339 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  70.39 
 
 
339 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  45.48 
 
 
341 aa  281  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  43.07 
 
 
333 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  43.37 
 
 
333 aa  276  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  42.77 
 
 
333 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  42.47 
 
 
333 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  42.47 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  42.47 
 
 
333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  42.47 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  42.77 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  42.47 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  42.17 
 
 
333 aa  271  9e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  44.44 
 
 
338 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  43.81 
 
 
338 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  43.49 
 
 
345 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  43.2 
 
 
338 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  41.09 
 
 
334 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  42.77 
 
 
339 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  43.2 
 
 
349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  43 
 
 
312 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  42.12 
 
 
339 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  41.74 
 
 
355 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  40.77 
 
 
356 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  40.06 
 
 
353 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  41.44 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  40.65 
 
 
341 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  40.82 
 
 
355 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  39.04 
 
 
351 aa  215  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  41.14 
 
 
346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2190  luciferase-like monooxygenase  40.06 
 
 
347 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  39.26 
 
 
340 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1091  Luciferase-like monooxygenase  36.04 
 
 
337 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.76 
 
 
340 aa  209  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2877  luciferase-like monooxygenase family protein  34.41 
 
 
337 aa  208  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819855  decreased coverage  0.0000897888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  38.73 
 
 
344 aa  206  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  37.84 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  39.04 
 
 
353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  36.39 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.73 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  37.65 
 
 
328 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.82 
 
 
357 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1544  luciferase family protein  36.06 
 
 
385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  36.94 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  35.58 
 
 
338 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  36.96 
 
 
335 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3480  luciferase family protein  40.48 
 
 
346 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  0.078624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  37.43 
 
 
349 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  37.43 
 
 
349 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1883  Luciferase-like monooxygenase  37.61 
 
 
342 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.560845  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1690  luciferase-like monooxygenase  39.08 
 
 
333 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0562  luciferase-like monooxygenase  39.08 
 
 
333 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.97 
 
 
341 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0739  luciferase-like monooxygenase superfamily protein  39.08 
 
 
375 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  38.77 
 
 
335 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1682  luciferase-like monooxygenase  39.08 
 
 
333 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1890  luciferase-like monooxygenase  39.08 
 
 
333 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  35.63 
 
 
339 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  37.43 
 
 
349 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0382  luciferase family protein  35.42 
 
 
333 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  37.05 
 
 
333 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0372  luciferase family protein  35.42 
 
 
333 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2268  luciferase  38.84 
 
 
402 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  36.61 
 
 
331 aa  192  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.28 
 
 
332 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  39.88 
 
 
333 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  35.8 
 
 
341 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4458  luciferase family protein  36.57 
 
 
350 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520717  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  36 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  35.63 
 
 
333 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  35.35 
 
 
347 aa  190  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  36.14 
 
 
330 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  38.97 
 
 
335 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1808  luciferase-like  35.67 
 
 
334 aa  189  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  35.63 
 
 
334 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  36.36 
 
 
333 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  34.74 
 
 
351 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  34.74 
 
 
351 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  34.05 
 
 
343 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1027  Luciferase-like monooxygenase  36.98 
 
 
342 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  36.04 
 
 
335 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  38.11 
 
 
338 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  35.44 
 
 
334 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  37.73 
 
 
333 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1983  luciferase family protein  34.02 
 
 
338 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437489  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2092  luciferase family protein  36.86 
 
 
333 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  40.36 
 
 
348 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  37.87 
 
 
361 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1533  flavin-dependent oxidoreductase  37.08 
 
 
349 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 
343 aa  185  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5876  luciferase family protein  38.6 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195682  normal  0.21189 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  36.94 
 
 
327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0394  putative luciferase-like monooxygenase  37.24 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.885628  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4429  luciferase family protein  38.6 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>