More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0394 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0394  putative luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
333 aa  670    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.885628  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1690  luciferase-like monooxygenase  77.34 
 
 
333 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0739  luciferase-like monooxygenase superfamily protein  77.34 
 
 
375 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2268  luciferase  77.04 
 
 
402 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27163  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0562  luciferase-like monooxygenase  77.34 
 
 
333 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1682  luciferase-like monooxygenase  77.34 
 
 
333 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1890  luciferase-like monooxygenase  77.34 
 
 
333 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1533  flavin-dependent oxidoreductase  71.82 
 
 
349 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3937  luciferase-like  71.56 
 
 
349 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334928  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5876  luciferase family protein  71.56 
 
 
349 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195682  normal  0.21189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4429  luciferase family protein  71.87 
 
 
349 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4190  luciferase family protein  71.04 
 
 
353 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3861  luciferase family protein  71.47 
 
 
349 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4321  luciferase-like monooxygenase  71.17 
 
 
349 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2406  luciferase  81.13 
 
 
265 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5560  Luciferase-like monooxygenase  58.9 
 
 
330 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705892  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7206  hypothetical protein  52.12 
 
 
333 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1696  Luciferase-like monooxygenase  54.19 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4360  luciferase family protein  52.42 
 
 
333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5196  hypothetical protein  53.05 
 
 
331 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2562  luciferase family protein  49.09 
 
 
323 aa  328  7e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  53.01 
 
 
389 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  53.01 
 
 
389 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  51.35 
 
 
386 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2092  luciferase family protein  48.52 
 
 
333 aa  302  4.0000000000000003e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2486  luciferase family oxidoreductase, group 1  46.48 
 
 
326 aa  282  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.536185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2146  Luciferase-like monooxygenase  45.87 
 
 
326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0527  Luciferase-like monooxygenase  46.39 
 
 
342 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0409  Luciferase-like monooxygenase  45.12 
 
 
329 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  41.19 
 
 
334 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  40 
 
 
333 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  40 
 
 
333 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  40 
 
 
333 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  40 
 
 
333 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  40 
 
 
333 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  40 
 
 
333 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  39.21 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  39.39 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  38.91 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  39.09 
 
 
333 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  38.42 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  37.84 
 
 
344 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  37.92 
 
 
339 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  37.69 
 
 
350 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  39.39 
 
 
356 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  36.14 
 
 
348 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  36.94 
 
 
339 aa  185  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  37.24 
 
 
341 aa  185  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  37.91 
 
 
355 aa  185  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  35.84 
 
 
348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.23 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  36.56 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.56 
 
 
349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  37.69 
 
 
351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  37.13 
 
 
338 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  35.99 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  34.13 
 
 
335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.78 
 
 
342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  37.76 
 
 
338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  37.39 
 
 
338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  35.82 
 
 
339 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  41.67 
 
 
339 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  35.84 
 
 
355 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3336  Luciferase-like monooxygenase  37.65 
 
 
352 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0310508  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  35.42 
 
 
340 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  38.11 
 
 
346 aa  169  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  36.78 
 
 
357 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  36.06 
 
 
328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  37.39 
 
 
336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  37.08 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  37.08 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  35.48 
 
 
335 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  37.01 
 
 
343 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  36.86 
 
 
397 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  37.39 
 
 
332 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  37.39 
 
 
332 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  36.66 
 
 
336 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.58 
 
 
337 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  37.39 
 
 
332 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1447  luciferase family protein  37.69 
 
 
336 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.765591  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  36.66 
 
 
352 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1097  luciferase-like  35.47 
 
 
334 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286853  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  37.46 
 
 
337 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  36.66 
 
 
424 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  36.15 
 
 
335 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  34.23 
 
 
330 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2861  Luciferase-like monooxygenase  34.69 
 
 
335 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  36.66 
 
 
352 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  36.66 
 
 
336 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  36.66 
 
 
352 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  34.11 
 
 
338 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  37.24 
 
 
338 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  37.12 
 
 
332 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.19 
 
 
338 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1883  Luciferase-like monooxygenase  37.1 
 
 
342 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.560845  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  32.43 
 
 
341 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  35.74 
 
 
338 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
333 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2190  luciferase-like monooxygenase  35.8 
 
 
347 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1027  Luciferase-like monooxygenase  35.1 
 
 
342 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>