More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4321 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1533  flavin-dependent oxidoreductase  91.69 
 
 		 349 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3937  luciferase-like  90.8 
 
 		 349 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334928  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3861  luciferase family protein  99.43 
 
 		 349 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4429  luciferase family protein  91.09 
 
 		 349 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4321  luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 349 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5876  luciferase family protein  90.54 
 
 		 349 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195682  normal  0.21189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4190  luciferase family protein  86.43 
 
 		 353 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1690  luciferase-like monooxygenase  77.78 
 
 		 333 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1682  luciferase-like monooxygenase  77.78 
 
 		 333 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1890  luciferase-like monooxygenase  77.78 
 
 		 333 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0562  luciferase-like monooxygenase  77.78 
 
 		 333 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0739  luciferase-like monooxygenase superfamily protein  77.78 
 
 		 375 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2268  luciferase  77.47 
 
 		 402 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27163  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0394  putative luciferase-like monooxygenase  71.95 
 
 		 333 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.885628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2406  luciferase  79.25 
 
 		 265 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5560  Luciferase-like monooxygenase  55.38 
 
 		 330 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7206  hypothetical protein  51.37 
 
 		 333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2562  luciferase family protein  48.48 
 
 		 323 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5196  hypothetical protein  52.89 
 
 		 331 aa  311  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1696  Luciferase-like monooxygenase  52.42 
 
 		 325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4360  luciferase family protein  48.48 
 
 		 333 aa  305  9.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  48.82 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  48.82 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  47.9 
 
 		 386 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2092  luciferase family protein  45.35 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2486  luciferase family oxidoreductase, group 1  45.4 
 
 		 326 aa  276  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.536185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2146  Luciferase-like monooxygenase  44.17 
 
 		 326 aa  265  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0527  Luciferase-like monooxygenase  47.2 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0409  Luciferase-like monooxygenase  45.96 
 
 		 329 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  37.88 
 
 		 333 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  38.18 
 
 		 333 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  37.88 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  37.88 
 
 		 333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  37.88 
 
 		 333 aa  215  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  37.58 
 
 		 333 aa  215  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  37.58 
 
 		 333 aa  215  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  37.58 
 
 		 333 aa  215  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  37.58 
 
 		 333 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  37.27 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.76 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  40.91 
 
 		 339 aa  199  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  36.92 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  37.13 
 
 		 339 aa  185  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  38.48 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.5 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  38.79 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  37.31 
 
 		 350 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  38.58 
 
 		 351 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  37.87 
 
 		 338 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  38.48 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  36.59 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  36.78 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  38.26 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  36.36 
 
 		 348 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.18 
 
 		 342 aa  176  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  33.23 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  39.62 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  36.36 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  38.04 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.99 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  35.4 
 
 		 341 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  37.08 
 
 		 355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  35.15 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  36.09 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  36.59 
 
 		 356 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  37.27 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2861  Luciferase-like monooxygenase  35.86 
 
 		 335 aa  159  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.83 
 
 		 338 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  36.81 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  36.81 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  36.81 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3336  Luciferase-like monooxygenase  39.64 
 
 		 352 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0310508  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  35.29 
 
 		 339 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3733  luciferase-like  40.23 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  45.97 
 
 		 346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03839  flavin dependent oxidoreductase  34.64 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  35.82 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1544  luciferase family protein  35.98 
 
 		 385 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  35.28 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7059  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  35.18 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1883  Luciferase-like monooxygenase  36.42 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.560845  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  33.14 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1808  luciferase-like  35.91 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.44 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  35.63 
 
 		 333 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  38.86 
 
 		 361 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  32.96 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  34.51 
 
 		 357 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  35.01 
 
 		 333 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  33.93 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  36.2 
 
 		 337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  36.2 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  32.55 
 
 		 333 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  33.73 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  41.15 
 
 		 337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  44.23 
 
 		 338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  34.53 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  34.62 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  33.33 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  34.34 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>