More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2562 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2562  luciferase family protein  100 
 
 
323 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  56.63 
 
 
386 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  57.7 
 
 
389 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  57.7 
 
 
389 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5560  Luciferase-like monooxygenase  56.35 
 
 
330 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705892  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7206  hypothetical protein  56.13 
 
 
333 aa  359  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2092  luciferase family protein  57.06 
 
 
333 aa  353  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4360  luciferase family protein  55.49 
 
 
333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5196  hypothetical protein  53.56 
 
 
331 aa  329  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0394  putative luciferase-like monooxygenase  49.09 
 
 
333 aa  328  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.885628  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1690  luciferase-like monooxygenase  50 
 
 
333 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1682  luciferase-like monooxygenase  50 
 
 
333 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1890  luciferase-like monooxygenase  50 
 
 
333 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2268  luciferase  50 
 
 
402 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27163  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0562  luciferase-like monooxygenase  50 
 
 
333 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0739  luciferase-like monooxygenase superfamily protein  50 
 
 
375 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2486  luciferase family oxidoreductase, group 1  50.77 
 
 
326 aa  324  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.536185  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4429  luciferase family protein  50 
 
 
349 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3937  luciferase-like  50 
 
 
349 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334928  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5876  luciferase family protein  49.7 
 
 
349 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195682  normal  0.21189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2146  Luciferase-like monooxygenase  50.61 
 
 
326 aa  312  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4190  luciferase family protein  49.85 
 
 
353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1533  flavin-dependent oxidoreductase  47.87 
 
 
349 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1696  Luciferase-like monooxygenase  52.63 
 
 
325 aa  299  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3861  luciferase family protein  48.78 
 
 
349 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4321  luciferase-like monooxygenase  48.48 
 
 
349 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0409  Luciferase-like monooxygenase  51.84 
 
 
329 aa  288  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0527  Luciferase-like monooxygenase  50 
 
 
342 aa  281  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2406  luciferase  50.75 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  39.04 
 
 
333 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  39.21 
 
 
333 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  39.04 
 
 
333 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  39.04 
 
 
333 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  38.91 
 
 
333 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  38.74 
 
 
333 aa  222  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  38.74 
 
 
333 aa  222  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  38.74 
 
 
333 aa  222  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  38.55 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.6 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  38.86 
 
 
333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  38.17 
 
 
345 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.58 
 
 
349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  36.56 
 
 
341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  35.63 
 
 
339 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  34.02 
 
 
344 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  36.25 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  38.55 
 
 
339 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  38.44 
 
 
339 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  36.75 
 
 
350 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  38.48 
 
 
338 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  38.53 
 
 
332 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.99 
 
 
341 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  37.24 
 
 
351 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  37.65 
 
 
334 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  36.7 
 
 
331 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  35.15 
 
 
338 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  36.78 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  37.13 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  36.47 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  36.47 
 
 
348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  37.69 
 
 
337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  37.31 
 
 
332 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  36.7 
 
 
331 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  35.4 
 
 
340 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  37.27 
 
 
339 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  35.42 
 
 
357 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  37 
 
 
332 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.76 
 
 
357 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  37 
 
 
332 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  37 
 
 
332 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  37.31 
 
 
332 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  34.95 
 
 
339 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2190  luciferase-like monooxygenase  36.5 
 
 
347 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  37 
 
 
332 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  34.24 
 
 
338 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  37.27 
 
 
328 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0356  luciferase family protein  35.15 
 
 
339 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  35.67 
 
 
335 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  34.04 
 
 
334 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  34.98 
 
 
335 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6408  luciferase-like monooxygenase  34.04 
 
 
329 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  36.67 
 
 
336 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  35.45 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  34.24 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  34.98 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  36.39 
 
 
351 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  36.39 
 
 
351 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  34.98 
 
 
335 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  35.38 
 
 
328 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  35.98 
 
 
343 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  33.73 
 
 
334 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  35.95 
 
 
335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  35.95 
 
 
341 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  33.73 
 
 
330 aa  165  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  36.39 
 
 
347 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  36.94 
 
 
397 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  34.67 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  33.73 
 
 
334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  33.63 
 
 
334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  34.67 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>