More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5560 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5560  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
330 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705892  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5196  hypothetical protein  65.56 
 
 
331 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0394  putative luciferase-like monooxygenase  58.9 
 
 
333 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.885628  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2268  luciferase  59.57 
 
 
402 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27163  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1690  luciferase-like monooxygenase  59.57 
 
 
333 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0562  luciferase-like monooxygenase  59.57 
 
 
333 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0739  luciferase-like monooxygenase superfamily protein  59.57 
 
 
375 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1682  luciferase-like monooxygenase  59.57 
 
 
333 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1890  luciferase-like monooxygenase  59.57 
 
 
333 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2562  luciferase family protein  56.35 
 
 
323 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4360  luciferase family protein  55.52 
 
 
333 aa  358  7e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4429  luciferase family protein  56 
 
 
349 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5876  luciferase family protein  56 
 
 
349 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195682  normal  0.21189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3937  luciferase-like  56 
 
 
349 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334928  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7206  hypothetical protein  53.29 
 
 
333 aa  349  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1533  flavin-dependent oxidoreductase  55.08 
 
 
349 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4190  luciferase family protein  55.69 
 
 
353 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1696  Luciferase-like monooxygenase  55.52 
 
 
325 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2092  luciferase family protein  50.46 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  51.66 
 
 
389 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  51.66 
 
 
389 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3861  luciferase family protein  55.38 
 
 
349 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  51.05 
 
 
386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4321  luciferase-like monooxygenase  55.38 
 
 
349 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2406  luciferase  61.65 
 
 
265 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2486  luciferase family oxidoreductase, group 1  49.23 
 
 
326 aa  301  8.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.536185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2146  Luciferase-like monooxygenase  48.77 
 
 
326 aa  294  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0409  Luciferase-like monooxygenase  49.38 
 
 
329 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0527  Luciferase-like monooxygenase  48.48 
 
 
342 aa  278  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  42.04 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  38.97 
 
 
333 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  38.97 
 
 
333 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  38.97 
 
 
333 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  39.27 
 
 
333 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  38.67 
 
 
333 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  38.67 
 
 
333 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  38.97 
 
 
333 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  38.67 
 
 
333 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  39.51 
 
 
333 aa  209  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  38.48 
 
 
333 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  38.19 
 
 
345 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  36.23 
 
 
335 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  37.46 
 
 
329 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  35.47 
 
 
341 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3336  Luciferase-like monooxygenase  39.88 
 
 
352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0310508  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  37.2 
 
 
351 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  37.01 
 
 
355 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02130  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.84 
 
 
329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307458  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  34.95 
 
 
349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  35.84 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  34.76 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  35.29 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6408  luciferase-like monooxygenase  36.86 
 
 
329 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3897  luciferase family protein  35.45 
 
 
329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  35.58 
 
 
350 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  35.14 
 
 
356 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1091  Luciferase-like monooxygenase  33.64 
 
 
337 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  45.45 
 
 
348 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12570  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  44.39 
 
 
335 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  45.79 
 
 
349 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3681  Luciferase-like monooxygenase  34.23 
 
 
330 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.26 
 
 
357 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  33.43 
 
 
347 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2190  luciferase-like monooxygenase  36.2 
 
 
347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  33.74 
 
 
341 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  35.76 
 
 
339 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  35.24 
 
 
339 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3184  Luciferase-like monooxygenase  33.64 
 
 
335 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0529886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  34.95 
 
 
334 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  33.03 
 
 
335 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  35.31 
 
 
343 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  34.76 
 
 
341 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1173  luciferase family protein  33.64 
 
 
335 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0583995  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  34.03 
 
 
347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3277  luciferase family oxidoreductase, group 1  37.67 
 
 
340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.967037  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1115  luciferase family protein  43.85 
 
 
335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1206  luciferase family protein  43.85 
 
 
335 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  33.73 
 
 
351 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  33.73 
 
 
351 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  33.53 
 
 
339 aa  153  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  35.76 
 
 
348 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  35.36 
 
 
355 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  43.35 
 
 
349 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  43.35 
 
 
349 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3480  luciferase family protein  38.07 
 
 
346 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  0.078624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  43.35 
 
 
349 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  35.45 
 
 
348 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  34.33 
 
 
339 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  35.61 
 
 
397 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2877  luciferase-like monooxygenase family protein  32.32 
 
 
337 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819855  decreased coverage  0.0000897888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0356  luciferase family protein  34.12 
 
 
339 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  40.76 
 
 
337 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  34.44 
 
 
338 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  32.63 
 
 
339 aa  149  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  33.63 
 
 
338 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0138  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.54 
 
 
329 aa  149  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.402113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  34.4 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  42.79 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  32.94 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  40.77 
 
 
335 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>