More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6567 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  92.54 
 
 
386 aa  696    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  100 
 
 
389 aa  767    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  100 
 
 
389 aa  767    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2562  luciferase family protein  57.7 
 
 
323 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2092  luciferase family protein  56.63 
 
 
333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7206  hypothetical protein  54.95 
 
 
333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4360  luciferase family protein  52.87 
 
 
333 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5560  Luciferase-like monooxygenase  51.66 
 
 
330 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705892  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0394  putative luciferase-like monooxygenase  53.01 
 
 
333 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.885628  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1690  luciferase-like monooxygenase  52.57 
 
 
333 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0739  luciferase-like monooxygenase superfamily protein  52.71 
 
 
375 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0562  luciferase-like monooxygenase  52.57 
 
 
333 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1682  luciferase-like monooxygenase  52.57 
 
 
333 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1890  luciferase-like monooxygenase  52.57 
 
 
333 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2268  luciferase  52.1 
 
 
402 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27163  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0527  Luciferase-like monooxygenase  53.66 
 
 
342 aa  316  5e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5196  hypothetical protein  50.6 
 
 
331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2486  luciferase family oxidoreductase, group 1  47.88 
 
 
326 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.536185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2146  Luciferase-like monooxygenase  47.88 
 
 
326 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4429  luciferase family protein  50 
 
 
349 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5876  luciferase family protein  50 
 
 
349 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195682  normal  0.21189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1533  flavin-dependent oxidoreductase  49.4 
 
 
349 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3937  luciferase-like  49.7 
 
 
349 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334928  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4190  luciferase family protein  49.4 
 
 
353 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0409  Luciferase-like monooxygenase  49.1 
 
 
329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1696  Luciferase-like monooxygenase  50.3 
 
 
325 aa  280  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4321  luciferase-like monooxygenase  48.82 
 
 
349 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3861  luciferase family protein  48.52 
 
 
349 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2406  luciferase  52.92 
 
 
265 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  39.71 
 
 
345 aa  202  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  35.94 
 
 
333 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  36.81 
 
 
333 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  35.94 
 
 
333 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  36.23 
 
 
333 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  35.65 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  35.65 
 
 
333 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  35.65 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  35.65 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.77 
 
 
334 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  36.23 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  35.09 
 
 
333 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  38.29 
 
 
348 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.34 
 
 
349 aa  175  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  38.29 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  37.72 
 
 
344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  36.73 
 
 
341 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  37.94 
 
 
339 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  34.6 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  37.75 
 
 
339 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  34.01 
 
 
335 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  37.61 
 
 
350 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  38.48 
 
 
352 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  35.69 
 
 
339 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  38.33 
 
 
424 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  38.31 
 
 
397 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  37.91 
 
 
334 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  37.46 
 
 
338 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  38.2 
 
 
352 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  37.01 
 
 
338 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4458  luciferase family protein  37.08 
 
 
350 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520717  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  38.2 
 
 
352 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3881  luciferase family protein  43.5 
 
 
365 aa  160  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  36.58 
 
 
339 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  39.29 
 
 
349 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  39.29 
 
 
349 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  41.43 
 
 
349 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  37.16 
 
 
338 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  38.78 
 
 
336 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3336  Luciferase-like monooxygenase  37.03 
 
 
352 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0310508  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.23 
 
 
342 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0382  luciferase family protein  33.04 
 
 
333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  36.54 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0372  luciferase family protein  33.04 
 
 
333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  38.48 
 
 
336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  35.8 
 
 
331 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12570  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.92 
 
 
335 aa  152  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  33.14 
 
 
330 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  39.43 
 
 
333 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  36.66 
 
 
335 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  43.5 
 
 
329 aa  149  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  33.79 
 
 
338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  33.82 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  33.63 
 
 
327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  36.57 
 
 
355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1286  luciferase family oxidoreductase, group 1  44.59 
 
 
355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0281951  normal  0.0214125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.33 
 
 
357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1091  Luciferase-like monooxygenase  30.33 
 
 
337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3681  Luciferase-like monooxygenase  33.73 
 
 
330 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  36.66 
 
 
343 aa  146  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  34.29 
 
 
332 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  33.9 
 
 
332 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  35.47 
 
 
336 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  33.9 
 
 
332 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  33.63 
 
 
335 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.71 
 
 
341 aa  146  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2237  luciferase family protein  36.87 
 
 
349 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1027  Luciferase-like monooxygenase  35.8 
 
 
342 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  36.66 
 
 
343 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  33.04 
 
 
327 aa  145  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  35 
 
 
351 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>