More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2486 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2486  luciferase family oxidoreductase, group 1  100 
 
 
326 aa  665    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.536185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2146  Luciferase-like monooxygenase  93.56 
 
 
326 aa  617  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0409  Luciferase-like monooxygenase  65.12 
 
 
329 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0527  Luciferase-like monooxygenase  63.91 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2562  luciferase family protein  50.77 
 
 
323 aa  324  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4360  luciferase family protein  51.82 
 
 
333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2092  luciferase family protein  48.47 
 
 
333 aa  312  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7206  hypothetical protein  49.85 
 
 
333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1690  luciferase-like monooxygenase  48.93 
 
 
333 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0562  luciferase-like monooxygenase  48.93 
 
 
333 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1682  luciferase-like monooxygenase  48.93 
 
 
333 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1890  luciferase-like monooxygenase  48.93 
 
 
333 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0739  luciferase-like monooxygenase superfamily protein  48.93 
 
 
375 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2268  luciferase  48.93 
 
 
402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27163  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  47.88 
 
 
389 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  47.88 
 
 
389 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5560  Luciferase-like monooxygenase  49.23 
 
 
330 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705892  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  46.81 
 
 
386 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0394  putative luciferase-like monooxygenase  46.48 
 
 
333 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.885628  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5876  luciferase family protein  46.63 
 
 
349 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195682  normal  0.21189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4429  luciferase family protein  46.63 
 
 
349 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5196  hypothetical protein  48.46 
 
 
331 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3937  luciferase-like  46.63 
 
 
349 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1533  flavin-dependent oxidoreductase  46.32 
 
 
349 aa  275  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4190  luciferase family protein  46.93 
 
 
353 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3861  luciferase family protein  45.57 
 
 
349 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1696  Luciferase-like monooxygenase  43.56 
 
 
325 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4321  luciferase-like monooxygenase  45.26 
 
 
349 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2406  luciferase  49.81 
 
 
265 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  42.04 
 
 
333 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  42.73 
 
 
333 aa  228  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  42.73 
 
 
333 aa  228  9e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  42.43 
 
 
333 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  41.67 
 
 
333 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  42.43 
 
 
333 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  42.56 
 
 
333 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  42.43 
 
 
333 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  42.43 
 
 
333 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  41.62 
 
 
333 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  41.67 
 
 
334 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  36.13 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.52 
 
 
349 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4458  luciferase family protein  35.24 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520717  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  36.05 
 
 
342 aa  172  9e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2877  luciferase-like monooxygenase family protein  35.63 
 
 
337 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819855  decreased coverage  0.0000897888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  34.82 
 
 
339 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1027  Luciferase-like monooxygenase  38.6 
 
 
342 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  33.43 
 
 
349 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  33.43 
 
 
349 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  34.81 
 
 
341 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  36.56 
 
 
351 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  33.15 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  35.63 
 
 
339 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  34.15 
 
 
334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  35.12 
 
 
350 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  35.12 
 
 
348 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  35.69 
 
 
348 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  34.51 
 
 
341 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1883  Luciferase-like monooxygenase  35.16 
 
 
342 aa  159  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.560845  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  32.43 
 
 
344 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0382  luciferase family protein  33.24 
 
 
333 aa  159  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0372  luciferase family protein  33.24 
 
 
333 aa  159  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  35.03 
 
 
339 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  32.74 
 
 
338 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1091  Luciferase-like monooxygenase  33.53 
 
 
337 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2044  Luciferase-like monooxygenase  34.29 
 
 
354 aa  155  9e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0320399  normal  0.0772623 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3497  luciferase family oxidoreductase, group 1  33.63 
 
 
346 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  33.03 
 
 
339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3881  luciferase family protein  34.29 
 
 
365 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  32.83 
 
 
355 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  34.66 
 
 
340 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1436  luciferase-like protein  33.83 
 
 
357 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2237  luciferase family protein  36.34 
 
 
349 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1790  luciferase-like monooxygenase  33.73 
 
 
341 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  32.23 
 
 
329 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  31.94 
 
 
338 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  36.4 
 
 
337 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  31.83 
 
 
335 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  32.14 
 
 
349 aa  149  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  33.63 
 
 
355 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  35.15 
 
 
346 aa  149  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2190  luciferase-like monooxygenase  34.5 
 
 
347 aa  149  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  37.2 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  29.45 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  32.33 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  32.53 
 
 
335 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1187  luciferase family protein  33.01 
 
 
331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  31.82 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  32.11 
 
 
338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  32.93 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  32.53 
 
 
335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  32.63 
 
 
331 aa  147  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  32.05 
 
 
347 aa  146  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  32.33 
 
 
335 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  31.14 
 
 
334 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2911  luciferase family protein  31.76 
 
 
348 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.425969 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3192  luciferase family protein  30.99 
 
 
335 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  34.04 
 
 
341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  32.83 
 
 
331 aa  145  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  31.53 
 
 
338 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>