More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5196 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5196  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  655    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5560  Luciferase-like monooxygenase  65.86 
 
 		 330 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7206  hypothetical protein  55.39 
 
 		 333 aa  355  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2268  luciferase  56.23 
 
 		 402 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27163  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1690  luciferase-like monooxygenase  56.23 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0562  luciferase-like monooxygenase  56.23 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0739  luciferase-like monooxygenase superfamily protein  56.23 
 
 		 375 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1682  luciferase-like monooxygenase  56.23 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1890  luciferase-like monooxygenase  56.23 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0394  putative luciferase-like monooxygenase  53.96 
 
 		 333 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.885628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2562  luciferase family protein  54.18 
 
 		 323 aa  347  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5876  luciferase family protein  56.4 
 
 		 349 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195682  normal  0.21189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4429  luciferase family protein  56.1 
 
 		 349 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3937  luciferase-like  56.1 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1533  flavin-dependent oxidoreductase  54.27 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  50.45 
 
 		 386 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  50.9 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  50.9 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4360  luciferase family protein  51.2 
 
 		 333 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4190  luciferase family protein  54.43 
 
 		 353 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1696  Luciferase-like monooxygenase  52.94 
 
 		 325 aa  315  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2092  luciferase family protein  48.94 
 
 		 333 aa  312  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3861  luciferase family protein  53.5 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4321  luciferase-like monooxygenase  53.19 
 
 		 349 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2406  luciferase  58.27 
 
 		 265 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2486  luciferase family oxidoreductase, group 1  48.46 
 
 		 326 aa  291  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.536185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2146  Luciferase-like monooxygenase  47.22 
 
 		 326 aa  282  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0527  Luciferase-like monooxygenase  48.35 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0409  Luciferase-like monooxygenase  45.43 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  39.74 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  37.27 
 
 		 333 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  36.97 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  36.97 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  36.97 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  36.97 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  36.97 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  36.97 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  36.89 
 
 		 333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  36.17 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  35.87 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  35.1 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.67 
 
 		 349 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  35.26 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2190  luciferase-like monooxygenase  36.53 
 
 		 347 aa  168  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  36.09 
 
 		 339 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  34.51 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3336  Luciferase-like monooxygenase  39.21 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0310508  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3467  luciferase-like  36.14 
 
 		 355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  35.52 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.69 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  35.12 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  33.83 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2748  luciferase-like  34.46 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  35.65 
 
 		 334 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  34.04 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2156  luciferase family protein  34.72 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0372  luciferase family protein  33.43 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0382  luciferase family protein  33.43 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3956  luciferase-like protein  35.31 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4030  luciferase family protein  35.31 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  35.93 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  34.85 
 
 		 339 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3970  luciferase family protein  35.31 
 
 		 349 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340597  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  33.84 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  34.51 
 
 		 339 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4458  luciferase family protein  36.5 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2462  hypothetical protein  35.78 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  38.15 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  43.9 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2341  Luciferase-like monooxygenase  35.67 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501344  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2731  Luciferase-like monooxygenase  35.03 
 
 		 348 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal  0.709488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  34.81 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  33.84 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  34.97 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  33.14 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3881  luciferase family protein  35.02 
 
 		 365 aa  153  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  34.43 
 
 		 351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  34.52 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1766  luciferase-like  38.15 
 
 		 338 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0136597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  32.63 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  34.24 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  34.23 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02070  Luciferase-like flavin monooxygenase  34.52 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  33.23 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1091  Luciferase-like monooxygenase  32.52 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  44.85 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  38.31 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  33.83 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3090  luciferase family protein  34.63 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266467  normal  0.324739 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  33.73 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  32.53 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6408  luciferase-like monooxygenase  34.44 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  33.73 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  33.43 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1101  luciferase family protein  32.9 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.624073  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  33.63 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10108  lkanal monooxygenase-like protein YvbT  40.49 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.842065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  33.63 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  33.63 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>